CAPTURING AND AMPLIFYING POLYNUCLEOTIDES

In some examples, a structure is contacted with polynucleotides having a variety of lengths and each including first and second adapters. The structure includes a substrate including first and second regions spaced apart from one another by a gap of at least 100 nm, a first set of capture primers co...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: DALY, John, MATHER, Brian, SARKAR, Krishnarjun, GEORGE, Wayne, MEADE, Allison, MONTAÑO-MACHADO, Vanessa, FISHER, Jeffrey, XI, Weixian, WENNING, Brandon, LESSARD-VIGER, Mathieu, TURK-MACLEOD, Rebecca, HONG, Sahngki, SUBRAMANIAN, Rohit, KRAFT, Lewis
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:In some examples, a structure is contacted with polynucleotides having a variety of lengths and each including first and second adapters. The structure includes a substrate including first and second regions spaced apart from one another by a gap of at least 100 nm, a first set of capture primers coupled to the first region of the substrate, and a second set of capture primers coupled to the second region of the substrate. The first adapter of the polynucleotide is hybridized to a capture primer of the first set of capture primers. Based on that polynucleotide being sufficiently long to bridge the gap, it is amplified using the first and second sets of capture primers. Based upon that polynucleotide being insufficiently long to bridge the gap, it is not amplified. Optionally, a wall may be disposed in the gap. Dans certains exemples, une structure est mise en contact avec des polynucléotides ayant une variété de longueurs et comprenant chacun des premier et second adaptateurs. La structure comprend un substrat présentant des première et seconde régions espacées l'une de l'autre par un espace d'au moins 100 nm, un premier ensemble d'amorces de capture couplé à la première région du substrat, et un second ensemble d'amorces de capture couplé à la seconde région du substrat. Le premier adaptateur du polynucléotide est hybridé à une amorce de capture du premier ensemble d'amorces de capture. Si le polynucléotide est suffisamment long pour combler l'espace, il est amplifié à l'aide des premier et second ensembles d'amorces de capture. Si le polynucléotide n'est pas suffisamment long pour combler l'espace, il n'est pas amplifié. Facultativement, une paroi peut être disposée dans l'espace.