SPATIAL TRANSPOSITION-BASED RNA SEQUENCING LIBRARY PREPARATION METHOD

An RNA sequencing library preparation process that that utilized transposition with or with a template switch oligonucleotide to generate the libraries having UMIs and spatial barcode information, and methods for improving RNA library preparation from tissue samples using template switching and ther...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: PODDAR, Anustup, MATHER, Brian, GHAZINEJAD, Olivia, STORMS, Lena, FLOWERS, Brittany, OSTROW, Andrew, ZHANG, Kerou, MANZO, Andrea, CANON, Se, SHEN, Fei, EKSTRAND, Mats, XIAO, Yao, APRIL, Craig
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:An RNA sequencing library preparation process that that utilized transposition with or with a template switch oligonucleotide to generate the libraries having UMIs and spatial barcode information, and methods for improving RNA library preparation from tissue samples using template switching and thermal amplification to improve RNA library quality. Un procédé de préparation de bibliothèque de séquençage d'ARN qui utilise une transposition avec ou sans oligonucléotide de commutation de modèle pour générer les bibliothèques ayant des UMI et des informations de code-barres spatial, et des procédés pour améliorer la préparation de bibliothèque d'ARN à partir d'échantillons de tissu à l'aide d'une commutation de modèle et d'une amplification thermique pour améliorer la qualité de bibliothèque d'ARN.