METHOD FOR ESTIMATING METABOLIC FLUX DISTRIBUTION, ANALYSIS DEVICE, AND PROGRAM
Provided is a method for estimating the metabolic flux distribution of cells, the method comprising: a step for acquiring discharge data including time-series data of a substance discharged to the outside of the cells with respect to a first strain cell and a second strain cell that is a reference f...
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Format: | Patent |
Sprache: | eng ; fre ; jpn |
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Zusammenfassung: | Provided is a method for estimating the metabolic flux distribution of cells, the method comprising: a step for acquiring discharge data including time-series data of a substance discharged to the outside of the cells with respect to a first strain cell and a second strain cell that is a reference for comparison; a step for calculating a discharge flux of the substance to the outside of the cells on the basis of the discharge data; a step for estimating a plurality of primary flux patterns on the basis of the discharge flux; and a step for clustering the plurality of primary flux patterns on the basis of the mutual similarity of the plurality of primary flux patterns and then outputting the clustered result.
L'invention concerne un procédé d'estimation de la distribution de flux métabolique de cellules, le procédé comprenant : une étape consistant à acquérir des données de décharge incluant des données chronologiques d'une substance déchargée à l'extérieur des cellules par rapport à une première cellule de souche et une seconde cellule de souche qui est une référence pour comparaison ; une étape consistant à calculer un flux de décharge de la substance à l'extérieur des cellules sur la base des données de décharge ; une étape consistant à estimer une pluralité de modèles de flux primaires sur la base du flux de décharge ; et une étape consistant à regrouper la pluralité de modèles de flux primaires sur la base de la similarité mutuelle de la pluralité de modèles de flux primaires et à délivrer ensuite le résultat groupé.
細胞の代謝フラックス分布の推定方法であって、第1株細胞および比較対象の第2株細胞の各々について、細胞外へ排出される物質の時系列データを含む排出データを取得するステップと、排出データに基づいて、細胞外への物質の排出フラックスを算出するステップと、排出フラックスに基づいて、複数の一次フラックスパターンを推定するステップと、複数の一次フラックスパターンの互いの類似度に基づいて、複数の一次フラックスパターンをクラスタリングして出力するステップとを備える。 |
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