METHODS AND SYSTEMS FOR ENCODED EFFECTOR SCREENING

The disclosure provides methods and systems for sample screening which may involve screening samples in presence and/or absence of effectors (e.g., encoded effector/compound libraries) for their potential effects on the sample or a target, in some cases, a sample comprising a cell or constituent of a cell, a target (e.g., an enzyme) in a cell or a target in a cell-free sample (e.g., in a biochemical assay with a purified target extracted from a cell). A variety of encoding modalities including nucleic acid barcodes and optical barcodes are disclosed. The methods and systems presented herein can comprise miniaturized systems for high-throughput sample screening with vast applications including but not limited to cell screening and cell perturbation analysis such as encoded effector library screening. La divulgation concerne des procédés et des systèmes de criblage d'échantillons qui peuvent impliquer le criblage d'échantillons en présence et/ou en l'absence d'effecteurs (par exemple, des bibliothèques d'effecteurs/composés codés) pour leurs effets potentiels sur l'échantillon ou une cible, dans certains cas, un échantillon comprenant une cellule ou un constituant d'une cellule, une cible (par exemple, une enzyme) dans une cellule ou une cible dans un échantillon acellulaire (par exemple, dans un dosage biochimique avec une cible purifiée extraite d'une cellule). Une variété de modalités de codage comprenant des codes-barres d'acide nucléique et des codes-barres optiques sont divulguées. Les procédés et les systèmes présentés ici peuvent comprendre des systèmes miniaturisés pour le criblage d'échantillons à haut débit avec des applications vasculaires comprenant, mais sans y être limitées, un criblage cellulaire et une analyse de perturbation cellulaire telle qu'un criblage de bibliothèque d'effecteurs codés.