NUCLEIC ACID PROBE COMPOSITIONS FOR ENRICHING, EXTRACTING, AND/OR DETECTING A VARIANT TARGET NUCLEIC ACID IN A SAMPLE

A nucleic acid probe composition for enriching, extracting, and/or detecting a variant target nucleic acid in a sample comprising the variant and a reference target nucleic acid is provided. The variant and reference each comprise a nucleic acid strand segment having a 5' end, a 3' end, and a nucleic acid sequence. The nucleic acid sequences of the strand segments are identical except that the variant comprises a substitution, insertion, or deletion of 1 to 100 nucleotides relative to the reference. The composition comprises a capture probe comprising an oligonucleotide that has 5' and 3' ends and comprises a variant target domain and either a 5' upstream toehold domain or a 3' downstream toehold domain. The composition also comprises an enhancement probe comprising an oligonucleotide that has 5' and 3' ends and comprises a reference target domain and either a 3' downstream toehold domain or a 5' upstream toehold domain. L'invention concerne une composition de sonde d'acide nucléique pour enrichir, extraire et/ou détecter un variant d'acide nucléique cible dans un échantillon comprenant le variant et un acide nucléique cible de référence. Le variant et la référence comprennent chacun un segment de brin d'acide nucléique ayant une extrémité 5 ', une extrémité 3'et une séquence d'acide nucléique. Les séquences d'acide nucléique des segments de brin sont identiques, sauf que la variante comprend une substitution, une insertion ou une délétion de 1 à 100 nucléotides par rapport à la référence. La composition comprend une sonde de capture comportant un oligonucléotide qui a des extrémités 5'et 3'e t comprend un domaine cible variant et soit un domaine "toehold" amont 5' soit un domaine "toehold" aval 3'. La composition comprend également une sonde d'amélioration comprenant un oligonucléotide qui a des extrémités 5'et 3' et comprend un domaine cible de référence et soit un domaine "toehold" en aval en 3' soit un domaine "toehold" en amont en 5'.