SYSTEMS AND METHODS FOR ANALYZING MICRO-RIBONUCLEIC ACID (MIRNA) SIGNATURE PROFILES IN BIOTIC AND ABIOTIC SAMPLES

Systems and methods for analyzing micro-ribonucleic acid (miRNA) signature profiles in a biological sample to identify profiles of a subject to biotic and abiotic agents are disclosed. A system comprises an extractor unit and a nucleic acid amplifying unit that communicate with one or more hardware...

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Hauptverfasser: VIERLING, Richard, SALEH, Nedal
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:Systems and methods for analyzing micro-ribonucleic acid (miRNA) signature profiles in a biological sample to identify profiles of a subject to biotic and abiotic agents are disclosed. A system comprises an extractor unit and a nucleic acid amplifying unit that communicate with one or more hardware processors. Extracted miRNA concentrations using extractor unit are amplified by nucleic acid amplifying unit, using a plurality of primers, and statistical modeling-based techniques. The one or more hardware processors analyze miRNA profiling data using statistical modeling-based techniques to identify a plurality of miRNA signature sequences and profiles indicative of exposure to various biotic and abiotic agents. The processors compare sequences and profiles with pre-defined miRNA signature sequences and profiles in a database and on a display, indicating the subject's response to each biotic or abiotic agent. The system can perform multiplexed extraction and amplification of miRNA sequences to improve efficiency. La présente invention concerne des systèmes et des procédés d'analyse des profils de signatures d'acides micro-ribonucléiques (miARN) dans un échantillon biologique afin d'identifier les profils d'un sujet soumis à des agents biotiques et abiotiques. Un système comprend une unité d'extraction et une unité d'amplification d'acide nucléique qui communiquent avec un ou plusieurs processeurs matériels. Les concentrations de miARN extraites à l'aide d'une unité d'extraction sont amplifiées par une unité d'amplification d'acide nucléique, à l'aide d'une pluralité d'amorces, et de techniques basées sur une modélisation statistique. Le ou les processeurs matériels analysent des données de profilage de miARN à l'aide de techniques basées sur une modélisation statistique pour identifier une pluralité de séquences de signature de miARN et de profils indicatifs d'une exposition à divers agents biotiques et abiotiques. Les processeurs comparent des séquences et des profils avec des séquences et des profils de signature de miARN prédéfinis dans une base de données et sur un dispositif d'affichage, indiquant la réponse du sujet à chaque agent biotique ou abiotique. Le système peut effectuer une extraction et une amplification multiplexées de séquences de miARN pour améliorer l'efficacité.