METHODS AND SYSTEMS FOR MODELING BIOLOGICAL SYSTEMS, AND APPLICATIONS THEREOF

The present disclosure provides methods and systems for modeling cellular behavior. A method for generating a model of a biological system may include obtaining sample data including records derived from samples of the biological system. The records may indicate the presence, absence, and/or expression levels of entities in respective samples of the biological system. The method may further include dividing the sample data into a training set and a validation set, providing biological system data as input to a machine learning model to initialize the model, training the model to model dynamic behavior of the biological system based on the training set, and validating the trained model using the validation set. The biological system data may include a bipartite graph representing the biological system and structured as an optimal control loop. La présente divulgation concerne des procédés et des systèmes de modélisation de comportement cellulaire. Un procédé de génération d'un modèle d'un système biologique peut consister à obtenir des données d'échantillon comprenant des enregistrements dérivés d'échantillons du système biologique. Les enregistrements peuvent indiquer la présence, l'absence et/ou les niveaux d'expression d'entités dans des échantillons respectifs du système biologique. Le procédé peut en outre consister à diviser les données d'échantillon en un ensemble d'apprentissage et en un ensemble de validation, à fournir des données de système biologique en tant qu'entrée à un modèle d'apprentissage automatique pour initialiser le modèle, à entraîner le modèle pour modéliser un comportement dynamique du système biologique sur la base de l'ensemble d'apprentissage, et à valider le modèle entraîné à l'aide de l'ensemble de validation. Les données de système biologique peuvent comprendre un graphe bipartite représentant le système biologique et structuré en tant que boucle de commande optimale.