METHODS AND SYSTEMS FOR DEFINING TEST SAMPLE READ COUNT LIMITS FOR A RANGE OF MICROBIAL SEQUENCE READS

Method and systems are provided for defining test sample read count limits for a range of microbial sequence reads. A computing device may generate a stabilization framework usable to determine a viability of a stabilization solution to stabilize a particular microbial species. The stabilization framework may include a first read count limit defined based on an enumerated abundance of the microbial species in a control sample multiplied by a first sequencing range value. The computing device may receive a read count value corresponding to an enumerated abundance of the microbial species in a mixture comprising a biological sample and the stabilization solution. The stabilization framework maybe applied to the read count value to generate an output based on whether the read count value exceeds the first read count limit. The computing device may then select, the stabilizing solution for use with subsequent biological samples. Un procédé et des systèmes pour définir des limites de comptage de lecture d'échantillon d'essai pour une plage de lectures de séquence microbienne. Un dispositif informatique peut générer une structure de stabilisation qui peut être utilisée pour déterminer la viabilité d'une solution de stabilisation pour stabiliser une espèce microbienne particulière. La structure de stabilisation peut comprendre une première limite de comptage de lecture définie sur la base d'une abondance énumérée des espèces microbiennes dans un échantillon témoin multiplié par une première valeur de plage de séquençage. Le dispositif informatique peut recevoir une valeur de comptage de lecture correspondant à une abondance énumérée de l'espèce microbienne dans un mélange comprenant un échantillon biologique et la solution de stabilisation. La structure de stabilisation peut être appliquée à la valeur de comptage de lecture pour générer une sortie selon que la valeur de comptage de lecture dépasse ou non la première limite de comptage de lecture. Le dispositif informatique peut ensuite sélectionner la solution de stabilisation pour l'utiliser avec des échantillons biologiques ultérieurs.