COMPUTER VISION FOR REAL-TIME SEGMENTATION OF FLUORESCENT BIOLOGICAL IMAGES

A segmentation system processes images of a sample that includes fluorescent entities. The segmentation system applies a threshold image that represents background illumination distinct from fluorescence of target entities to pre-process the images. The segmentation system determines numbers of target entities in pre-processed images and determines whether an estimated number of target entities in the sample meets a threshold certainty. The segmentation system continues to analyze one or more images until the threshold certainty is determined. When the threshold certainty is met, the estimated number of target entities may be used to generate a user interface output (e.g., displaying the pre-processed images and visual indicators of the locations of target entities). Système de segmentation traite des images d'un échantillon qui comprend des entités fluorescentes. Le système de segmentation applique une image de seuil qui représente un éclairage d'arrière-plan distinct de la fluorescence d'entités cibles pour prétraiter les images. Le système de segmentation détermine des nombres d'entités cibles dans des images prétraitées et détermine si un nombre estimé d'entités cibles dans l'échantillon satisfait une certitude de seuil. Le système de segmentation continue à analyser une ou plusieurs images jusqu'à ce que la certitude de seuil soit déterminée. Lorsque la certitude de seuil est satisfaite, le nombre estimé d'entités cibles peut être utilisé pour générer une sortie d'interface utilisateur (par exemple, pour afficher les images prétraitées et des indicateurs visuels des emplacements des entités cibles.