PRE-ENRICHMENT FOR SINGLE-CELL ANALYSIS FOR DETECTING MEASUREMENTS OF RESIDUAL DISEASE AND ANALYZING CIRCULATING TUMOR CELLS

Disclosed herein are methods for analyzing rare disease cells of a plurality of subjects. The methods include obtaining a plurality of samples from the plurality of subjects; for each sample in the plurality of samples, enriching the sample to obtain rare disease cells; pooling the obtained rare disease cells across the plurality of samples; providing the pooled rare disease cells for single-cell analysis to generate amplicons derived from analytes of the pooled rare disease cells; sequencing the amplicons derived from analytes of the pooled rare disease cells; clustering the rare disease cells across the plurality of samples using the sequenced amplicons; and de-multiplexing the rare disease cells by assigning clusters of rare disease cells to individual subjects of the plurality of subjects. La présente invention divulgue des méthodes d'analyse de cellules de maladies rares d'une pluralité de sujets. Les méthodes comprennent l'obtention d'une pluralité d'échantillons à partir de la pluralité de sujets ; pour chaque échantillon dans la pluralité d'échantillons, l'enrichissement de l'échantillon en vue d'obtenir des cellules de maladie rare ; le regroupement des cellules de maladies rares obtenues à travers la pluralité d'échantillons ; fournir les cellules de maladies rares regroupées pour une analyse de cellules uniques pour générer des amplicons dérivés d'analytes des cellules de maladies rares regroupées ; le séquençage des amplicons dérivés d'analytes des cellules de maladies rares regroupées ; le regroupement des cellules de maladies rares à travers la pluralité d'échantillons à l'aide des amplicons séquencés ; et le démultiplexage des cellules de maladies rares en attribuant des groupes de cellules de maladies rares à des sujets individuels de la pluralité de sujets.