METHODS AND SYSTEMS FOR GENERATING SEQUENCING LIBRARIES

Methods and systems for targeted detection of circulating tumor DNA (ctDNA) molecules are disclosed herein. In some cases, a molecular sequencing library depleted of methylated DNA can be generated and used to detect ctDNA in a cell-free DNA sample reliably at a lower sequencing depth and lower cost...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: CIRLAN, Iulia, BRATMAN, Scott V, BURGENER, Justin M, SINGHANIA, Rajat, SHEN, Shu Yi, DINIZ DE CARVALHO, Daniel
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:Methods and systems for targeted detection of circulating tumor DNA (ctDNA) molecules are disclosed herein. In some cases, a molecular sequencing library depleted of methylated DNA can be generated and used to detect ctDNA in a cell-free DNA sample reliably at a lower sequencing depth and lower cost than existing methods. La présente invention concerne des procédés et des systèmes pour la détection ciblée de molécules d'ADN tumoral circulant (ADNtc). Dans certains cas, une banque de séquençage moléculaire appauvrie en ADN méthylé peut être générée et utilisée pour détecter l'ADNtc dans un échantillon d'ADN acellulaire de manière fiable, à une profondeur de séquençage plus faible et à un coût inférieur à celui des procédés existants.