TANDEM TRIPLE QUADRUPOLE MASS SPECTROMETER-BASED SCREENING AND CONFIRMATION METHOD FOR ANALYZING PROTEIN AND ITS VARIANTS

The present disclosure relates to a system and method for screening and confirming protein and protein variants in tandem triple quadrupole mass spectrometer (TQMS) using pseudo-Parallel Reaction Monitoring (pPRM) method. More particularly, the invention provides complete peptide spectra, comprising all the amino acids of the peptide, in a single analysis. In additional embodiments, the invention deals with the Pseudo Parallel Reaction Monitoring (pPRM) method using Electrospray Ionization Triple Quadrupole Mass Spectrometer (ESI TQMS). The method is a QUALITATIVE test to CONFIRM the PRESENCE of the protein and its variants of interest and can be used with or without a separating device like liquid chromatography. This is achieved by monitoring the product ions (>5 ions) OR ALL THE PRODUCT IONS ('y' ion series) of the peptide. La présente divulgation se rapporte à un système et à un procédé permettant de cribler et de confirmer une protéine et des variants protéiques dans un spectromètre de masse en tandem triple quadripôle (TQMS) à l'aide d'un procédé de surveillance de réaction pseudo-parallèle (pPRM). Plus particulièrement, l'invention concerne des spectres peptidiques complets, comprenant tous les acides aminés du peptide, dans une seule analyse. Dans d'autres modes de réalisation, l'invention concerne le procédé de surveillance de réaction pseudo-parallèle (pPRM) utilisant un spectromètre de masse triple quadripôle à ionisation par électronébulisation (ESI TQMS). Le procédé est un test QUALITATIF pour CONFIRMER la PRÉSENCE de la protéine et de ses variants d'intérêt et peut être utilisé avec ou sans dispositif de séparation comme la chromatographie liquide. Ceci est obtenu par la surveillance des ions de produit (ions > 5) OU TOUS LES IONS DE PRODUIT (série d'ions « y ») du peptide.