METHODS AND COMPOSITIONS FOR IMPROVED SNP DISCRIMINATION

Compositions and methods for improved SNP discrimination are provided. An exemplary composition comprises a programmable nuclease and a non-naturally occurring guide nucleic acid that hybridizes to a target nucleic acid, or segment thereof, comprising at least one single-nucleotide polymorphism (SNP...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: BROUGHTON, James Paul, HENDRIKS, Carley Gelenter, CHEN, Janice Sha, CHING, Jesus, MCKAY, Bridget Ann Paine, FASCHING, Clare Louise
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:Compositions and methods for improved SNP discrimination are provided. An exemplary composition comprises a programmable nuclease and a non-naturally occurring guide nucleic acid that hybridizes to a target nucleic acid, or segment thereof, comprising at least one single-nucleotide polymorphism (SNP). Methods may comprise a) contacting the sample to: i) a detector nucleic acid and ii) the composition; and b) assaying for a signal indicative of cleavage of the detector nucleic acid by the first programmable nuclease. In an exemplary embodiment, the target nucleic acid is a coronavirus target nucleic acid. L'Invention concerne des Compositions et des procédés pour une discrimination de SNP améliorée. Une composition donnée à titre d'exemple comprend une nucléase programmable et un acide nucléique de guidage non naturel qui s'hybride à un acide nucléique cible, ou Un segment de celui-ci, comprenant au moins un polymorphisme mononucléotidique (SNP). Les procédés peuvent comprendre a) la mise en contact de l'échantillon avec : i) un acide nucléique détecteur et ii) la composition ; et b) le dosage d'un signal indicatif du clivage de l'acide nucléique détecteur par la première nucléase programmable. Dans un mode de réalisation donné à titre d'exemple, l'acide nucléique cible est un acide nucléique cible de coronavirus.