ADAPTIVE BASE CALLING SYSTEMS AND METHODS

Methods for updating a system comprising a sequencer are described herein. In some exemplary methods, the system is updated through generating sequencing data for a plurality of nucleic acid molecule colonies, selecting sequencing data for a subset of the nucleic acid molecule colonies, calling preliminary sequences for the subset of the nucleic acid colonies, mapping the called preliminary sequences to a known reference sequence, and updating the pre-trained sequencer- specific machine-learning model. Also described herein are systems for carrying out such methods and computer readable memory for storing such methods. L'invention concerne des procédés de mise à jour d'un système comprenant un séquenceur. Dans certains modes de réalisation donnés à titre d'exemple, le système est mis à jour par génération de données de séquençage pour une pluralité de colonies de molécules d'acide nucléique, sélectionner des données de séquençage pour un sous-ensemble des colonies de molécules d'acide nucléique, appeler des séquences préliminaires pour le sous-ensemble des colonies d'acides nucléiques, mettre en correspondance des séquences préliminaires appelées avec une séquence de référence connue, et mettre à jour le modèle d'apprentissage machine spécifique d'un séquenceur pré-entraîné. L'invention concerne également des systèmes pour mettre en œuvre de tels procédés et une mémoire lisible par ordinateur pour stocker de tels procédés.