MACHINE LEARNING-BASED COMPLEX MARKER FOR DETERMINING NONALCOHOLIC STEATOHEPATITIS, AND USE THEREOF

The present invention relates to a biomarker composition for diagnosing chronic liver diseases. In order to select, as biomarkers, genes exhibiting a difference in expression between patients with fatty liver and patients with nonalcoholic steatohepatitis, genes selected through a differentially exp...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: LEE, Yong-Sun, OH, Sumin, SEONG, Rho Hyun, LEE, Yeon Su, BEAK, Yang Hyun, HAN, Sangyoung, RYU, Kyung Hyun, PARK, Jong Hoon
Format: Patent
Sprache:eng ; fre ; kor
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Beschreibung
Zusammenfassung:The present invention relates to a biomarker composition for diagnosing chronic liver diseases. In order to select, as biomarkers, genes exhibiting a difference in expression between patients with fatty liver and patients with nonalcoholic steatohepatitis, genes selected through a differentially expressed gene (DEG) method and genes selected using a feature set are collected so that a set of genes, with high accuracy, of CAPG, HYAL3, WIPI1, TREM2, SPP1, and RNASE6 is selected, and it has been identified that fatty liver and nonalcoholic steatohepatitis can be distinguished with high accuracy by using the selected gene set in a patient group-based data clinical model, and thus the set of genes composed of CAPG, HYAL3, WIPI1, TREM2, SPP1, and RNASE6 are provided as biomarkers for the diagnosis of chronic liver diseases and nonalcoholic steatohepatitis. La présente invention concerne une composition de biomarqueur pour le diagnostic des maladies hépatiques chroniques. Afin de sélectionner, en tant que biomarqueurs, des gènes présentant une différence d'expression entre les patients atteints de stéatose hépatique et les patients atteints de stéatohépatite non alcoolique, les gènes sélectionnés par un procédé de gènes exprimés de manière différentielle (DEG) et les gènes sélectionnés à l'aide d'un ensemble de caractéristiques sont rassemblés afin de sélectionner un ensemble de gènes, avec une grande précision, constitué de CAPG, HYAL3, WIPI1, TREM2, SPP1 et RNASE6, et il a été identifié que la stéatose hépatique et la stéatohépatite non alcoolique peuvent être distinguées avec une grande précision en utilisant l'ensemble de gènes sélectionnés dans un modèle clinique de données basé sur un groupe de patients, et ainsi l'ensemble de gènes composé de CAPG, HYAL3, WIPI1, TREM2, SPP1, et RNASE6 sont fournis comme biomarqueurs pour le diagnostic des maladies chroniques du foie et de la stéatohépatite non alcoolique. 본 발명은 만성간질환 진단용 바이오마커 조성물에 관한 것으로, 지방간 환자와 비알콜성지방간염 환자 사이에서 발현의 차이를 나타내는 유전자들을 바이오마커로 선별하기 위해, DEG(differentially expressed gene) 기법을 통해 선별된 유전자들과 특징부 세트(feature set)로 선별된 유전자들을 추합하여 정밀도(accuracy)가 높은 CAPG, HYAL3, WIPI1, TREM2, SPP1, 및 RNASE6 유전자 세트를 선별하고, 환자군 기반의 데이터 임상모델에서 선별된 유전자 세트로 지방간 및 비알콜성지방간염을 높은 정확도로 구분할 수 있음을 확인함으로써, CAPG, HYAL3, WIPI1, TREM2, SPP1, 및 RNASE6으로 구성된 유전자 세트를 만성간질환 및 비알콜성지방간염의 진단을 위한 바이오마커로 제공된다.