MACHINE LEARNING TECHNIQUES FOR ESTIMATING TUMOR CELL EXPRESSION COMPLEX TUMOR TISSUE

Techniques for using machine learning to estimate tumor expression levels of genes in tumor cells. The techniques include obtaining expression data for a set of genes comprising a first plurality of genes associated with the tumor cells and a second plurality of genes associated with tumor microenvironment cells; determining the tumor expression levels of the first plurality of genes in the tumor cells using a plurality of machine learning models, the determining comprising: generating a first set of features for the first gene; providing the first set of features as input to the first machine learning model to obtain an output comprising a tumor microenvironment expression level estimate of the first gene in the tumor microenvironment cells; and determining a first tumor expression level for the first gene in the tumor cells using the output of the first machine learning model and a total expression level for the first gene. La présente invention concerne des techniques d'utilisation de l'apprentissage machine pour estimer les niveaux d'expression tumorale de gènes dans des cellules tumorales. Les techniques consistent à obtenir des données d'expression pour un ensemble de gènes comprenant une première pluralité de gènes associés aux cellules tumorales et une seconde pluralité de gènes associés à des cellules du micro-environnement tumoral ; à déterminer les niveaux d'expression tumorale de la première pluralité de gènes dans les cellules tumorales à l'aide d'une pluralité de modèles d'apprentissage machine, la détermination consistant à : générer un premier ensemble de caractéristiques pour le premier gène ; fournir le premier ensemble de caractéristiques en tant qu'entrée au premier modèle d'apprentissage machine pour obtenir une sortie comprenant une estimation de niveau d'expression de micro-environnement tumoral du premier gène dans les cellules de micro-environnement tumoral ; et déterminer un premier niveau d'expression tumorale pour le premier gène dans les cellules tumorales à l'aide de la sortie du premier modèle d'apprentissage machine et d'un niveau d'expression total pour le premier gène.