OPTIMIZED OLIGONUCLEOTIDE TX PROBE FOR A MULTIPLEXING ANALYSIS OF NUCLEIC ACIDS AND A MULTIPLEXING METHOD

The present invention provides a, preferably fully automated and/or multiplex, method for the simultaneous detection of a plurality of molecular genetic analytes in a collective and continuous reaction set up and at least one analyte specific oligonucleotide TX probes with a cleavable hydrolysis pro...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: LIPINSKY NUNES, Joao, SCHANZENBACH, Christoph, BRABETZ, Werner
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:The present invention provides a, preferably fully automated and/or multiplex, method for the simultaneous detection of a plurality of molecular genetic analytes in a collective and continuous reaction set up and at least one analyte specific oligonucleotide TX probes with a cleavable hydrolysis product for use in said method. Through the method the plurality of cleavable hydrolysis products is specifically released by a nuclease from the respective TX probes. Following a separation step, preferably in a capillary electrophoresis, for each hydrolysis product a clear and distinguishable from others signal is achieved. Each separated hydrolysis product respectively results in a signal enabling the qualitative and/or quantitative detection of each analyte comprising a molecular variant, e.g. single nucleotide polymorphism (SNP), deletion-insertion polymorphism (DIP) or other, respectively, that was targeted specifically by the plurality of TX probes. Preferably, the method is suitable to detect qualitatively and/or quantitatively small molecular variants as such SNP. La présente invention concerne un procédé, de préférence entièrement automatisé et/ou multiplex, pour la détection simultanée d'une pluralité d'analytes génétiques moléculaires dans un montage réactionnel collectif et continu et au moins une sonde TX oligonucléotidique spécifique de l'analyte avec un produit d'hydrolyse clivable à utiliser dans ledit procédé. Par le biais du procédé, la pluralité de produits d'hydrolyse clivables est spécifiquement libérée par une nucléase à partir des sondes TX respectives. Après une étape de séparation, de préférence dans une électrophorèse capillaire, on obtient pour chaque produit d'hydrolyse un signal clair et distinct des autres signaux. Chaque produit d'hydrolyse séparé conduit respectivement à un signal permettant la détection qualitative et/ou quantitative de chaque analyte comprenant un variant moléculaire, par exemple un polymorphisme mononucléotidique (SNP), un polymorphisme d'insertion par délétion (DIP) ou un autre, respectivement, qui a été ciblé spécifiquement par la pluralité de sondes TX. De préférence, le procédé est approprié pour détecter qualitativement et/ou quantitativement de petits variants moléculaires comme de tels SNP.