METHODS FOR PEPTIDE MAPPING OF ADENO-ASSOCIATED VIRUS (AAV) PROTEINS

The present disclosure relates to a method of characterizing proteins in a sample. The method includes: removing non-ionic surfactant from the sample via denaturing size-exclusion chromatography to form a denatured sample; eluting the denatured sample via liquid chromatography to collect fractions of the sample, wherein the fractions of the sample include a protein fraction; lyophilizing the protein fraction to increase protein concentration; reconstituting the lyophilized protein fraction with a buffer comprising a surfactant to denature the protein; digesting the denatured protein fraction with an enzyme; and analyzing the digested protein fraction. La présente divulgation concerne un procédé de caractérisation de protéines dans un échantillon. Le procédé comprend : l'élimination du tensioactif non ionique de l'échantillon par chromatographie d'exclusion de taille dénaturante pour former un échantillon dénaturé ; l'élution de l'échantillon dénaturé par chromatographie en phase liquide pour recueillir des fractions de l'échantillon, les fractions de l'échantillon comprenant une fraction protéique ; la lyophilisation de la fraction protéique pour augmenter la concentration protéique ; la reconstitution de la fraction protéique lyophilisée avec un tampon comprenant un tensioactif pour dénaturer la protéine ; la digestion de la fraction protéique dénaturée avec une enzyme ; et l'analyse de la fraction protéique digérée.