METHODS FOR PRODUCTION AND QUANTIFICATION OF UNIQUE MOLECULAR IDENTIFIER-LABELED BEADS

Described herein are compositions and methods for the production and quantification of barcoded or unique molecular identifier (UMI)-labeled substrates. In one aspect, the substrate is a bead comprising a template oligonucleotide that is elongated by successive extension reactions to provide a bead with an oligonucleotide comprising a plurality of barcodes and conserved anchor regions. The oligonucleotide may also comprise a poly-T region for the capture and subsequent sequencing of mRNA. Methods are also described for quantifying the amount of template oligonucleotide loaded onto the substrate and the products of the extension reaction after each round and after the final extension. Sont décrites ici, des compositions et des procédés destinés à la production et à la quantification de substrats marqués par codes à barres ou par un identifiant moléculaire unique (UMI). Selon un aspect, le substrat est une bille comprenant un oligonucléotide matrice qui est allongé par des réactions d'extension successives pour former une bille avec un oligonucléotide comprenant une pluralité de codes-barres et de régions d'ancrage conservées. L'oligonucléotide peut également comprendre une région poly-T pour la capture et le séquençage ultérieur d'ARNm. Sont également décrits, des procédés permettant de quantifier la quantité d'oligonucléotide matrice chargé sur le substrat et les produits de la réaction d'extension après chaque cycle et après l'extension finale.