MASS SPECTROMETRY BASED SYSTEMS AND METHODS FOR IMPLEMENTING MULTISTAGE MS/MS ANALYSIS

Mass spectrometry (MS) based systems and methods of implementing multi-stage MS/MS analysis for identification of experimental glycolipid samples are described. A processor communicatively coupled to a memory and a reference spectral database (1) implements a first stage analysis of glycan fragment...

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: GUO, Zhongwu, BASSO, Kari B, GAO, Tianqi, ZHAO, Jinying, BAILEY, Laura S, HUANG, Fanran
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:Mass spectrometry (MS) based systems and methods of implementing multi-stage MS/MS analysis for identification of experimental glycolipid samples are described. A processor communicatively coupled to a memory and a reference spectral database (1) implements a first stage analysis of glycan fragment data including determining, based on a matching reference glycan of a candidate reference glycolipid, a glycan structure of a glycan portion of the experimental glycolipid. The processor further (2) implements a second stage analysis of lipid fragment data including performing a spectral comparison of one or more MS/MS spectral values of a shifted experimental lipid fragment data with one or more MS/MS spectral values of matching reference lipid fragment data of the candidate reference glycolipid. A combination of the determined glycan fragments and lipid fragments gives the structure of each specific glycolipid in the experimental glycolipid sample. Systèmes basés sur la spectrométrie de masse (MS) et procédés de mise en œuvre d'une analyse MS/MS à plusieurs étages permettant l'identification d'échantillons de glycolipides expérimentaux. Un processeur couplé en communication à une mémoire et à une base de données spectrale de référence (1) met en œuvre une analyse de premier étage de données de fragment de glycane consistant à déterminer, sur la base d'un glycane de référence correspondant d'un glycolipide de référence candidat, une structure de glycane d'une partie de glycane du glycolipide expérimental. Le processeur (2) met en œuvre une analyse de second étage de données de fragment de lipide consistant à exécuter une comparaison spectrale d'une ou de plusieurs valeurs spectrales MS/MS d'une donnée de fragment de lipide expérimental décalé avec une ou plusieurs valeurs spectrales MS/MS de données de fragment lipidique de référence correspondantes du glycolipide de référence candidat. Une combinaison des fragments de glycane et des fragments de lipide déterminés donne la structure de chaque glycolipide spécifique dans l'échantillon de glycolipide expérimental.