METHOD OF DETECTING INFECTION WITH PATHOGENS CAUSING TUBERCULOSIS

The present invention refers to methods of detecting an infection with pathogens causing tuberculosis comprising the steps of a) contacting a first aliquot of a sample of an individual with at least one antigen of a pathogen causing tuberculosis, b) incubating the first aliquot with the at least one antigen for about 15 to about 23 hours, c) adding a cell lysing reagent which is preferably able to stabilize RNA in a temperature range of about 0°C to about 40°C for about 2 h to about 48 h, d) performing an RNA extraction from the mixture obtained in step c), wherein RNA is extracted from the mixture obtained in step c) without any prior washing or separation steps, e) detecting in the first aliquot and in a second aliquot of the sample of the individual the marker IFNG, CXCL10 and at least one housekeeping gene using a 1-step or 2-step reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR), wherein the second aliquot has not been incubated with the at least one antigen, and f) comparing at least one of the detected markers in the first aliquot with the detected markers in the second aliquot, preferably in a fold change analysis, more preferably in a classifier method. In addition, the present invention refers to a first and second kit for performing the methods according to the present invention or one or more single steps thereof. La présente invention concerne des procédés de détection d'une infection par des agents pathogènes provoquant la tuberculose, comprenant les étapes suivantes : a) mise en contact d'une première aliquote d'un échantillon d'un individu avec au moins un antigène d'un agent pathogène provoquant la tuberculose ; b) incubation de la première aliquote avec l'au moins un antigène pendant environ 15 à environ 23 heures ; c) ajout d'un réactif de lyse cellulaire qui est de préférence capable de stabiliser l'ARN dans une plage de température d'environ 0,5°C ; d) ajout d'un réactif de lyse cellulaire qui est de préférence capable de stabiliser l'ARN dans une plage de température d'environ 0,5°C, b) incubation de la première aliquote avec le au moins un antigène pendant environ 15 à environ 23 heures, c) ajout d'un réactif de lyse cellulaire qui est de préférence capable de stabiliser l'ARN dans une plage de température d'environ 0°C à environ 40°C pendant environ 2 h à environ 48 h, d) réalisation d'une extraction d'ARN à partir du mélange obtenu à l'étape c), dans laquelle l'ARN est extrait du mélange obtenu à l'ét