PATHOGEN TESTING

A point of care device, comprises a chamber configured to contain a swab. Once a swab is loaded, the device introduces a buffer into the chamber, then lyses cells collected by the swab. Probes such as padlock probes target a specified content such as a virus (e.g., SARS-CoV-2 RNA) and will bind, splint ligate, and rapidly isothermally amplify (e.g., using rolling circle amplification). Also described is a wastewater pathogen tracking dashboard and schema for detecting and tracking pathogen spread within communities by monitoring microbial and viral RNA. Un dispositif d'analyse sur le lieu de soin comprend un espace conçu pour contenir un écouvillon. Une fois qu'un écouvillon est chargé, le dispositif introduit un tampon dans l'espace, puis lyse les cellules recueillies par l'écouvillon. Des sondes telles que des sondes cadenas ciblent un contenu prédéfini tel qu'un virus (par exemple, un ARN du SARS-CoV-2) et vont se lier, se ligaturer par attelle et subir une amplification isothermique rapide (par exemple, par amplification par cercle roulant). L'invention concerne également un tableau de bord de suivi d'agents pathogènes dans les eaux usées et un schéma de détection et de suivi de la propagation d'agents pathogènes en milieu urbain par surveillance d'ARN microbiens et viraux.