SYSTEMS AND METHODS FOR DECONVOLUTION OF EXPRESSION DATA
Techniques for determining one or more cell composition percentages from expression data. The techniques include obtaining expression data for a biological sample, the biological sample previously obtained from a subject, the expression data including first expression data associated with a first se...
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Format: | Patent |
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Zusammenfassung: | Techniques for determining one or more cell composition percentages from expression data. The techniques include obtaining expression data for a biological sample, the biological sample previously obtained from a subject, the expression data including first expression data associated with a first set of genes associated with a first cell type; determining a first cell composition percentage for the first cell type using the expression data and one or more non-linear regression models including a first non-linear regression model, wherein the first cell composition percentage indicates an estimated percentage of cells of the first cell type in the biological sample, wherein determining the first cell composition percentage for the first cell type comprises: processing the first expression data with the first non-linear regression model to determine the first cell composition percentage for the first cell type; and outputting the first cell composition percentage.
L'invention concerne des techniques destinées à déterminer un ou plusieurs pourcentages de composition de cellules à partir de données d'expressions. Les techniques consistent à obtenir des données d'expressions pour un échantillon biologique, l'échantillon biologique ayant été obtenu préalablement d'un sujet, les données d'expressions incluant des premières données d'expressions associées à un premier ensemble de gènes associés à un premier type de cellules ; à déterminer un premier pourcentage de composition de cellules pour le premier type de cellules au moyen des données d'expressions et d'un ou plusieurs modèles de régression non linéaire incluant un premier modèle de régression non linéaire, le premier pourcentage de composition de cellules indiquant un pourcentage estimé de cellules du premier type de cellules dans l'échantillon biologique, la détermination du premier pourcentage de composition de cellules pour le premier type de cellules consistant : à traiter les premières données d'expressions avec le premier modèle de régression non linéaire pour déterminer le premier pourcentage de composition de cellules pour le premier type de cellules ; et à transmettre le premier pourcentage de composition de cellules. |
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