SYSTEMS AND METHODS FOR ASSESSING CELL GROWTH RATES

A method of facilitating a growth assessment for a cell line includes generating an image of a well that contains a medium that was inoculated with at least one cell of the cell line. The method also includes generating a down-sampled segmentation map comprising pixels that indicate an inferred presence or absence of a cell colony in corresponding portions of the well image. Generating the down-sampled segmentation map includes inputting the well image to a fully convolutional neural network having a plurality of convolutional layers. The method also includes (i) determining, by inputting colony size information (including the down-sampled segmentation map and/or a pixel count derived therefrom) to a cell growth assessment algorithm, a growth classification or score for the cell line, and causing a display of the growth classification or score, and/or (II) causing a display of the colony size information to facilitate a manual cell growth assessment. Procédé pour faciliter une évaluation de croissance pour une lignée cellulaire comprenant la génération d'une image d'un puits qui contient un milieu qui a été inoculé avec au moins une cellule de la lignée cellulaire. Le procédé comprend également la génération d'une carte de segmentation sous-échantillonnée comprenant des pixels qui indiquent une présence ou une absence inférée d'une colonie de cellules dans des parties correspondantes de l'image de puits. La génération de la carte de segmentation sous-échantillonnée comprend l'entrée de l'image de puits dans un réseau neuronal totalement convolutif ayant une pluralité de couches de convolution. Le procédé comprend également (i) la détermination, par l'entrée d'informations de taille de colonie (comprenant la carte de segmentation sous-échantillonnée et/ou un comptage de pixels dérivé de celle-ci) dans un algorithme d'évaluation de croissance cellulaire, d'une classification ou d'un score de croissance pour la lignée cellulaire, et la réalisation d'un affichage de la classification ou du score de croissance, et/ou (II) la réalisation d'un affichage des informations de taille de colonie pour faciliter une évaluation de croissance de cellule manuelle.