METHOD, COMPOSITION AND KIT FOR SIZE SELECTIVE ENRICHMENT OF NUCLEIC ACIDS

Provided is a method for isolating and concentrating nucleic acids of selected target sizes (e.g., in increments less than 1000 base pairs) from a biological fluid mixture comprising combining the biological fluid mixture and a first aqueous two-phase system (ATPS) formed from a first phase forming...

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Hauptverfasser: KITTUR, Harsha Madan, KOBAYASHI, Masae, CHIU, Yin To, MARSHAK, Daniel
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:Provided is a method for isolating and concentrating nucleic acids of selected target sizes (e.g., in increments less than 1000 base pairs) from a biological fluid mixture comprising combining the biological fluid mixture and a first aqueous two-phase system (ATPS) formed from a first phase forming polymer or surfactant component dissolved in a first phase solution, and a second phase solution, such that target nucleic acid fragments below a desired target size partition to said second phase solution and contaminants partition to the first phase solution, extracting and mixing the second phase solution with a second ATPS formed from a second phase forming polymer or surfactant component dissolved in a third phase solution and a fourth phase solution, such that the target nucleic acid fragments partition to and concentrate in the third phase solution, and recovering the concentrated target nucleic acid fragments from the third phase solution. A composition and kit for isolating and concentrating nucleic acids of selected target sizes as described above are also provided. L'invention concerne un procédé d'isolement et de concentration d'acides nucléiques de tailles cibles sélectionnées (par exemple, par augmentations inférieures à 1000 paires de bases) à partir d'un mélange de fluides biologiques comprenant la combinaison du mélange de fluides biologiques et d'une première extraction à deux phases aqueuses formée à partir d'un premier polymère formant une phase ou d'un composant tensioactif dissous dans une première solution de phase, ainsi qu'une une seconde solution de phase, de telle sorte que des fragments d'acide nucléique cible au-dessous d'une taille cible souhaitée se séparent dans ladite seconde solution de phase et des contaminants se séparent dans la première solution de phase; l'extraction et le mélange de la deuxième solution de phase avec une seconde extraction à deux phases aqueuses formée à partir d'un second polymère formant une phase ou d'un composant tensioactif dissous dans une troisième solution de phase et une quatrième solution de phase, de telle sorte que les fragments d'acide nucléique cible se séparent et se concentrent dans la troisième solution de phase; et la récupération des fragments d'acides nucléiques cibles concentrés à partir de la troisième solution de phase. L'invention concerne également une composition et un kit d'isolement et de concentration d'acides nucléiques de tailles cibles sélectionnées tels que décrits ci-dessu