SYSTEMS AND METHODS FOR ANALYZING SEQUENCING DATA

The disclosed subject matter provides systems and methods for identifying bioactivities of biopolymers from sequence data of the biopolymers. The disclosed system can include a processor configured to receive the input data and a storage medium including instructions operable when executed by the pr...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: RUBE, Hans Tomas, RASTOGI, Chaitanya, BUSSEMAKER, Harmen H
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:The disclosed subject matter provides systems and methods for identifying bioactivities of biopolymers from sequence data of the biopolymers. The disclosed system can include a processor configured to receive the input data and a storage medium including instructions operable when executed by the processors. The instructions can cause the system to obtain the input data and generate an evaluative model configured to acquire a biophysical model parameter, a model interaction parameter, a count table parameter, or combinations thereof utilizing the input data. The evaluative model can be configured to simultaneously use multiple biophysical models to represent one or more sequence recognition modes of the biopolymers, evaluate the biopolymers using the evaluative model, and generate a value using the evaluating model that corresponds to the bioactivity of each biopolymer. L'invention concerne des systèmes et des procédés pour identifier des bioactivités de biopolymères à partir de données de séquence des biopolymères. Le système selon l'invention peut comprendre un processeur configuré pour recevoir les données d'entrée et un support de stockage comprenant des instructions activables lorsqu'elles sont exécutées par les processeurs. Les instructions peuvent amener le système à obtenir les données d'entrée et générer un modèle d'évaluation configuré pour acquérir un paramètre de modèle biophysique, un paramètre d'interaction de modèle, un paramètre de table de comptage, ou des combinaisons de ceux-ci utilisant les données d'entrée. Le modèle d'évaluation peut être configuré pour utiliser simultanément de multiples modèles biophysiques pour représenter un ou plusieurs modes de reconnaissance de séquence des biopolymères, évaluer les biopolymères à l'aide du modèle d'évaluation, et générer une valeur à l'aide du modèle d'évaluation qui correspond à la bioactivité de chaque biopolymère.