MULTI-OMIC SEARCH ENGINE FOR INTEGRATIVE ANALYSIS OF CANCER GENOMIC AND CLINICAL DATA

A method is provided for utilizing multi-omic data indices for tumor profiling. The method can comprise storing a plurality of multi-omic data indices, wherein each of the plurality of multi-omic data indices comprises cancer-specific tokenized data; ingesting additional multi-omic data and any annotations associated with the additional multi-omic data, the additional multi-omic data related to one or more indices; indexing the ingested additional multi-omic data and annotations while preserving gene names, gene variant names and multi-omic mapping between different data streams for the same patient in the specific index, to produce tokenized ingested additional multi-omic data; receiving a user query; selecting one or more relevant multi-omic data indices based on the user query; ranking the selected one or more multi-omic data indices based on at least one of clinical actionability, pathogenicity, feature weight, or frequency; and returning the ranked one or more multi-omic data indices to the user. L'invention concerne un procédé d'utilisation d'indices de données multi-omiques pour le profilage de tumeurs. Le procédé peut comprendre le stockage d'une pluralité d'indices de données multidimensionnelles, chacun de la pluralité d'indices de données multi-omiques comprenant des données marquées spécifiques au cancer ; l'importation de données multi-omiques supplémentaires et d'éventuelles annotations associées aux données multi-omiques supplémentaires, les données multi-omiques supplémentaires associées à un ou plusieurs indices ; l'indexation des données multi-omiques supplémentaires importées et des annotations tout en préservant les noms de gènes, les noms de variants de gènes et une mise en correspondance multi-omique entre différents flux de données pour le même patient dans l'index spécifique, pour produire des données multi-omiques importées marquées ; la réception d'une requête d'utilisateur ; la sélection d'un ou de plusieurs indices de données multi-omiques pertinents sur la base de la requête d'utilisateur ; le classement de l'un ou des indices de données multi-omiques sélectionnés sur la base d'une capacité d'actionabilité clinique, d'une pathogénicité, d'une pondération de caractéristique ou d'une fréquence ; et le renvoi de l'un ou des indices de données multi-omiques classés à l'utilisateur.