METHODS AND SYSTEMS FOR ASSESSING MICROSATELLITE INSTABILITY

The invention disclosed herein generally relates to methods of assessing microsatellite instability in a subject. In an aspect, the present disclosure provides a computer-implemented method of assessing microsatellite instability of a subject, comprising: obtaining a quantitative measure of a plural...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: PETERMAN, Neil, SRIVAS, Rohith Kannappan, ROBERTSON, Alexander De Jong, TEZCAN, Haluk, LAMBERT, Nicole Jacinda, YALAMANCHILI, Ram
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
container_end_page
container_issue
container_start_page
container_title
container_volume
creator PETERMAN, Neil
SRIVAS, Rohith Kannappan
ROBERTSON, Alexander De Jong
TEZCAN, Haluk
LAMBERT, Nicole Jacinda
YALAMANCHILI, Ram
description The invention disclosed herein generally relates to methods of assessing microsatellite instability in a subject. In an aspect, the present disclosure provides a computer-implemented method of assessing microsatellite instability of a subject, comprising: obtaining a quantitative measure of a plurality of microsatellite repeat elements from a blood sample of a subject; processing the plurality of quantitative measures to obtain a statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures; and detecting a presence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures satisfies a predetermined criterion, or detecting an absence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures does not satisfy the predetermined criterion. L'invention concerne d'une manière générale des procédés d'évaluation de l'instabilité de microsatellites chez un sujet. Selon un aspect, la présente invention concerne un procédé mis en œuvre par ordinateur pour évaluer l'instabilité de microsatellites d'un sujet, consistant à : obtenir une mesure quantitative d'une pluralité d'éléments de répétition de microsatellites contenus dans un échantillon sanguin d'un sujet ; traiter la pluralité de mesures quantitatives pour obtenir une mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ; et détecter une présence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives satisfait à un critère prédéfini , ou détecter une absence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ne satisfait pas au critère prédéfini.
format Patent
fullrecord <record><control><sourceid>epo_EVB</sourceid><recordid>TN_cdi_epo_espacenet_WO2020056347A1</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>WO2020056347A1</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-epo_espacenet_WO2020056347A13</originalsourceid><addsrcrecordid>eNrjZLDxdQ3x8HcJVnD0c1EIjgwOcfUNVnDzD1JwDA52DQ729HNX8PV0DvIPdgxx9fHxDHFV8PQLDnF08gSyI3kYWNMSc4pTeaE0N4Oym2uIs4duakF-fGpxQWJyal5qSXy4v5GBkYGBqZmxibmjoTFxqgDflSrw</addsrcrecordid><sourcetype>Open Access Repository</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>patent</recordtype></control><display><type>patent</type><title>METHODS AND SYSTEMS FOR ASSESSING MICROSATELLITE INSTABILITY</title><source>esp@cenet</source><creator>PETERMAN, Neil ; SRIVAS, Rohith Kannappan ; ROBERTSON, Alexander De Jong ; TEZCAN, Haluk ; LAMBERT, Nicole Jacinda ; YALAMANCHILI, Ram</creator><creatorcontrib>PETERMAN, Neil ; SRIVAS, Rohith Kannappan ; ROBERTSON, Alexander De Jong ; TEZCAN, Haluk ; LAMBERT, Nicole Jacinda ; YALAMANCHILI, Ram</creatorcontrib><description>The invention disclosed herein generally relates to methods of assessing microsatellite instability in a subject. In an aspect, the present disclosure provides a computer-implemented method of assessing microsatellite instability of a subject, comprising: obtaining a quantitative measure of a plurality of microsatellite repeat elements from a blood sample of a subject; processing the plurality of quantitative measures to obtain a statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures; and detecting a presence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures satisfies a predetermined criterion, or detecting an absence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures does not satisfy the predetermined criterion. L'invention concerne d'une manière générale des procédés d'évaluation de l'instabilité de microsatellites chez un sujet. Selon un aspect, la présente invention concerne un procédé mis en œuvre par ordinateur pour évaluer l'instabilité de microsatellites d'un sujet, consistant à : obtenir une mesure quantitative d'une pluralité d'éléments de répétition de microsatellites contenus dans un échantillon sanguin d'un sujet ; traiter la pluralité de mesures quantitatives pour obtenir une mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ; et détecter une présence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives satisfait à un critère prédéfini , ou détecter une absence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ne satisfait pas au critère prédéfini.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2020</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20200319&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2020056347A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76547</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20200319&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2020056347A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>PETERMAN, Neil</creatorcontrib><creatorcontrib>SRIVAS, Rohith Kannappan</creatorcontrib><creatorcontrib>ROBERTSON, Alexander De Jong</creatorcontrib><creatorcontrib>TEZCAN, Haluk</creatorcontrib><creatorcontrib>LAMBERT, Nicole Jacinda</creatorcontrib><creatorcontrib>YALAMANCHILI, Ram</creatorcontrib><title>METHODS AND SYSTEMS FOR ASSESSING MICROSATELLITE INSTABILITY</title><description>The invention disclosed herein generally relates to methods of assessing microsatellite instability in a subject. In an aspect, the present disclosure provides a computer-implemented method of assessing microsatellite instability of a subject, comprising: obtaining a quantitative measure of a plurality of microsatellite repeat elements from a blood sample of a subject; processing the plurality of quantitative measures to obtain a statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures; and detecting a presence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures satisfies a predetermined criterion, or detecting an absence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures does not satisfy the predetermined criterion. L'invention concerne d'une manière générale des procédés d'évaluation de l'instabilité de microsatellites chez un sujet. Selon un aspect, la présente invention concerne un procédé mis en œuvre par ordinateur pour évaluer l'instabilité de microsatellites d'un sujet, consistant à : obtenir une mesure quantitative d'une pluralité d'éléments de répétition de microsatellites contenus dans un échantillon sanguin d'un sujet ; traiter la pluralité de mesures quantitatives pour obtenir une mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ; et détecter une présence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives satisfait à un critère prédéfini , ou détecter une absence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ne satisfait pas au critère prédéfini.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2020</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNrjZLDxdQ3x8HcJVnD0c1EIjgwOcfUNVnDzD1JwDA52DQ729HNX8PV0DvIPdgxx9fHxDHFV8PQLDnF08gSyI3kYWNMSc4pTeaE0N4Oym2uIs4duakF-fGpxQWJyal5qSXy4v5GBkYGBqZmxibmjoTFxqgDflSrw</recordid><startdate>20200319</startdate><enddate>20200319</enddate><creator>PETERMAN, Neil</creator><creator>SRIVAS, Rohith Kannappan</creator><creator>ROBERTSON, Alexander De Jong</creator><creator>TEZCAN, Haluk</creator><creator>LAMBERT, Nicole Jacinda</creator><creator>YALAMANCHILI, Ram</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20200319</creationdate><title>METHODS AND SYSTEMS FOR ASSESSING MICROSATELLITE INSTABILITY</title><author>PETERMAN, Neil ; SRIVAS, Rohith Kannappan ; ROBERTSON, Alexander De Jong ; TEZCAN, Haluk ; LAMBERT, Nicole Jacinda ; YALAMANCHILI, Ram</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_WO2020056347A13</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2020</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>PETERMAN, Neil</creatorcontrib><creatorcontrib>SRIVAS, Rohith Kannappan</creatorcontrib><creatorcontrib>ROBERTSON, Alexander De Jong</creatorcontrib><creatorcontrib>TEZCAN, Haluk</creatorcontrib><creatorcontrib>LAMBERT, Nicole Jacinda</creatorcontrib><creatorcontrib>YALAMANCHILI, Ram</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>PETERMAN, Neil</au><au>SRIVAS, Rohith Kannappan</au><au>ROBERTSON, Alexander De Jong</au><au>TEZCAN, Haluk</au><au>LAMBERT, Nicole Jacinda</au><au>YALAMANCHILI, Ram</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>METHODS AND SYSTEMS FOR ASSESSING MICROSATELLITE INSTABILITY</title><date>2020-03-19</date><risdate>2020</risdate><abstract>The invention disclosed herein generally relates to methods of assessing microsatellite instability in a subject. In an aspect, the present disclosure provides a computer-implemented method of assessing microsatellite instability of a subject, comprising: obtaining a quantitative measure of a plurality of microsatellite repeat elements from a blood sample of a subject; processing the plurality of quantitative measures to obtain a statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures; and detecting a presence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures satisfies a predetermined criterion, or detecting an absence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures does not satisfy the predetermined criterion. L'invention concerne d'une manière générale des procédés d'évaluation de l'instabilité de microsatellites chez un sujet. Selon un aspect, la présente invention concerne un procédé mis en œuvre par ordinateur pour évaluer l'instabilité de microsatellites d'un sujet, consistant à : obtenir une mesure quantitative d'une pluralité d'éléments de répétition de microsatellites contenus dans un échantillon sanguin d'un sujet ; traiter la pluralité de mesures quantitatives pour obtenir une mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ; et détecter une présence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives satisfait à un critère prédéfini , ou détecter une absence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ne satisfait pas au critère prédéfini.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
fulltext fulltext_linktorsrc
identifier
ispartof
issn
language eng ; fre
recordid cdi_epo_espacenet_WO2020056347A1
source esp@cenet
subjects BEER
BIOCHEMISTRY
CHEMISTRY
COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR
CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES
ENZYMOLOGY
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS
METALLURGY
MICROBIOLOGY
MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS
SPIRITS
VINEGAR
WINE
title METHODS AND SYSTEMS FOR ASSESSING MICROSATELLITE INSTABILITY
url https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2024-12-27T02%3A46%3A31IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-epo_EVB&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:patent&rft.genre=patent&rft.au=PETERMAN,%20Neil&rft.date=2020-03-19&rft_id=info:doi/&rft_dat=%3Cepo_EVB%3EWO2020056347A1%3C/epo_EVB%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true