METHODS AND SYSTEMS FOR ASSESSING MICROSATELLITE INSTABILITY

The invention disclosed herein generally relates to methods of assessing microsatellite instability in a subject. In an aspect, the present disclosure provides a computer-implemented method of assessing microsatellite instability of a subject, comprising: obtaining a quantitative measure of a plural...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: PETERMAN, Neil, SRIVAS, Rohith Kannappan, ROBERTSON, Alexander De Jong, TEZCAN, Haluk, LAMBERT, Nicole Jacinda, YALAMANCHILI, Ram
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:The invention disclosed herein generally relates to methods of assessing microsatellite instability in a subject. In an aspect, the present disclosure provides a computer-implemented method of assessing microsatellite instability of a subject, comprising: obtaining a quantitative measure of a plurality of microsatellite repeat elements from a blood sample of a subject; processing the plurality of quantitative measures to obtain a statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures; and detecting a presence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures satisfies a predetermined criterion, or detecting an absence of the microsatellite instability (MSI) of the subject when the statistical measure of deviation of the plurality of quantitative measures does not satisfy the predetermined criterion. L'invention concerne d'une manière générale des procédés d'évaluation de l'instabilité de microsatellites chez un sujet. Selon un aspect, la présente invention concerne un procédé mis en œuvre par ordinateur pour évaluer l'instabilité de microsatellites d'un sujet, consistant à : obtenir une mesure quantitative d'une pluralité d'éléments de répétition de microsatellites contenus dans un échantillon sanguin d'un sujet ; traiter la pluralité de mesures quantitatives pour obtenir une mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ; et détecter une présence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives satisfait à un critère prédéfini , ou détecter une absence de l'instabilité des microsatellites (MSI) du sujet lorsque la mesure statistique de l'écart de la pluralité de mesures quantitatives ne satisfait pas au critère prédéfini.