SPECIFICATION METHOD, SPECIFICATION PROGRAM, AND INFORMATION PROCESSING DEVICE

An information processing device (100) compares, for each codon sequence position, a codon included in reference codon sequence data, and a codon included in codon sequence data to be analyzed. The information processing device (100) specifies a plurality of codons following a codon based on a seque...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: KATAOKA, Masahiro, TOMOBE, Akihiro, MIYAZAKI, Toshiya
Format: Patent
Sprache:eng ; fre ; jpn
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Beschreibung
Zusammenfassung:An information processing device (100) compares, for each codon sequence position, a codon included in reference codon sequence data, and a codon included in codon sequence data to be analyzed. The information processing device (100) specifies a plurality of codons following a codon based on a sequence position where the codons do not match. The information processing device (100) refers to a storage unit in which a class of mutation is associated and stored with a plurality of codons following a codon based on the sequence position of a certain codon where the class of mutation occurs in the codon. The information processing device (100) specifies the class of mutation associated with the plurality of codons. Cette invention concerne un dispositif de traitement d'informations (100) qui compare, pour chaque position de séquence de codons, un codon inclus dans des données de séquence de codons de référence, et un codon inclus dans des données de séquence de codons à analyser. Le dispositif de traitement d'informations (100) spécifie une pluralité de codons suivant un codon sur la base d'une position de séquence où les codons ne correspondent pas. Le dispositif de traitement d'informations (100) se réfère à une unité de stockage dans laquelle une classe de mutation est associée et stockée avec une pluralité de codons suivant un codon sur la base de la position de séquence d'un certain codon où la classe de mutation se produit dans le codon. Le dispositif de traitement d'informations (100) spécifie la classe de mutation associée à la pluralité de codons. 情報処理装置(100)は、基準コドン配列データに含まれるコドンと、分析対象コドン配列データに含まれるコドンとを、コドンの配列位置毎に比較する。情報処理装置(100)は、コドンが不一致となる配列位置を基準としたコドンに後続する複数のコドンを特定する。情報処理装置(100)は、突然変異の種別を、あるコドンに突然変異が生じることであるコドンの配列位置を基準としたコドンに後続する複数のコドンに対応付けて記憶する記憶部を参照する。情報処理装置(100)は、複数のコドンに対応づけられた突然変異の種別を特定する。