DNA METHYLATION BIOMARKER OF AGING FOR HUMAN EX VIVO AND IN VIVO STUDIES

DNA methylation (DNAm) based biomarkers of aging have been developed for many tissues and organs. However, these biomarkers have sub-optimal accuracy in skin cells, fibroblasts and other cell types that are often used in ex vivo studies. To address this challenge, we analyzed DNA methylation array data sets derived from multiple sources of DNA, from which we developed a novel and highly robust DNAm age estimator (based on 391 CpGs) for human fibroblasts, keratinocytes, buccal cells, endothelial cells, lymphoblastoid cells, skin, blood, and saliva samples. The application of this new age estimator to ex vivo cell culture systems revealed that cellular population doubling is generally accompanied by an increase in epigenetic aging. The new skin & blood clock disclosed herein is useful for ex vivo and in vivo studies of human aging. Des biomarqueurs de vieillissement basés sur la méthylation de l'ADN (ADNm) ont été développés pour de nombreux tissus et organes. Cependant, ces biomarqueurs ont une précision sous-optimale dans les cellules de la peau, les fibroblastes et d'autres types de cellules qui sont souvent utilisés dans des études ex vivo. Pour relever ce défi, nous avons analysé des ensembles de données de réseau de méthylation d'ADN dérivés de multiples sources d'ADN, à partir desquels nous avons développé un nouvel estimateur d'âge de basé sur l'ADNm très robuste (basé sur 391 CpG) pour des échantillons de fibroblastes, de kératinocytes, de cellules buccales, de cellules endothéliales, de cellules lymphoblastoïdes, de peau, de sang et de salive humains. L'application de ce nouvel estimateur d'âge à des systèmes de culture cellulaire ex vivo a révélé que le doublement de la population cellulaire s'accompagne généralement d'une augmentation du vieillissement épigénétique. La nouvelle horloge cutanée et sanguine de la peau de la présente invention est utile pour des études ex vivo et in vivo du vieillissement humain.