HETEROCHIRAL NUCLEIC ACID STRAND-DISPLACEMENT SYSTEMS AND METHODS

In an embodiment, a strand displacement system including a DNA/PNA complex, an input DNA strand, where the DNA/PNA complex binds to the input DNA strand forming a complex and displaces a PNA intermediate and forms an activated domain on the PNA, and a Bi complex that reacts with the activated domain...

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Hauptverfasser: SCZEPANSKI, Jonathan T, YOUNG, Brian E, KABZA, Adam M
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:In an embodiment, a strand displacement system including a DNA/PNA complex, an input DNA strand, where the DNA/PNA complex binds to the input DNA strand forming a complex and displaces a PNA intermediate and forms an activated domain on the PNA, and a Bi complex that reacts with the activated domain on the PNA to thereby release an output DNA strand. In an additional embodiment, a fluorogenic sensor including a heteroduplex between an achiral PNA strand and a fluorogenic aptamer, where the fluorogenic aptamer includes L-RNA, an input DNA strand, where the input DNA strand binds to the heteroduplex and displaces an incumbent fluorogenic aptamer strand and forms an activated domain on that strand, and a dye. Un mode de réalisation concerne un système de déplacement de brin comprenant un complexe ADN/APN, un brin d'ADN d'entrée, le complexe ADN/APN se liant au brin d'ADN d'entrée formant un complexe et déplaçant un intermédiaire APN et formant un domaine activé sur l'APN, et un complexe Bi qui réagit avec le domaine activé sur l'APN pour ainsi libérer un brin d'ADN de sortie. Dans un mode de réalisation supplémentaire, un capteur fluorogène comprenant un hétéroduplex entre un brin d'APN achiral et un aptamère fluorogène, l'aptamère fluorogène comprenant un L-ARN, un brin d'ADN d'entrée, le brin d'ADN d'entrée se liant à l'hétéroduplex et déplaçant un brin d'aptamère fluorogène en place et formant un domaine activé sur ce brin, et un colorant.