SYSTEM OF DETECTING THE MOST SIGNIFICANT PROKARYOTIC REPRESENTATIVES OF THE HUMAN INTESTINAL MICROBIOTA ON THE BASIS OF A PCR PANEL

This invention relates to the field of biotechnology and concerns a set of synthetic oligonucleotides for identifying marker portions of genes in bacteria and archaea in the human intestinal microbiota. A novel method for profiling the intestinal microbiota of an individual has been developed and experimentally tested which is based on semiquantitative and qualitative determination of representatives of prokaryotic taxa that have a described association with various human pathologies and are the most well-represented in the human intestinal microbiota. The set described in the present invention comprises oligonucleotides specific to and capable of hybridizing with 16S rRNA gene fragments of the bacterial and archaeal taxa indicated in the description. Said set makes it possible to increase the accuracy and speed of determining microorganisms potentially responsible for human diseases. La présente invention concerne le domaine de la biotechnologie et se présente comme un kit d'oligonucléotides synthétiques pour déceler les zones de marqueurs de gènes de bactéries et archées à partir du microbiote humain. On a mis au point et testé de manière expérimental un nouveau procédé de profilage du microbiote intestinal d'un individu qui est basé sur une détermination semi-quantitative et qualitative des représentants de taxons procaryotes qui correspondent à l'association décrite avec telles ou autres pathologies de l'humain et sont largement représentées dans le microbiote intestinal humain. Le kit de la présente invention comprend des oligonucléotides spécifiques à et capables de s'hybrider avec les fragments génomiques 16S d'ARN ribosomal indiqués dans la description des taxons bactériens et archéens. Le présent kit permet d'améliorer la précision et la vitesse de détermination de micro-organismes potentiellement responsables de maladies humaines. Настоящее изобретение относится к области биотехнологии и представляет собой набор синтетических олигонуклеотидов для выявления маркерных участков генов бактерий и архей из микробиоты кишечника человека. Был разработан и экспериментально протестирован новый способ профилирования микробиоты кишечника индивида, который основан на полуколичественном и качественном определении представителей прокариотических таксонов, которые имеют описанную ассоциацию с теми или иными патологиями человека и наиболее представлены в микробиоте кишечника человека. Описанный в настоящем изобретении набор включает олигонуклеотиды, специфичные к