METHODS FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING PULMONARY COLONIZATION/INFECTION BY PSEUDOMONAS AERUGINOSA

The present invention relates to methods for predicting the risk of developing pulmonary colonization/infection by P. aeruginosa. The inventors analyzed the respiratory tract microbiota from 65 patients sputum samples and compared microbiota data. The inventors found that patients that will remain u...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: KERAVEC, Marlène, MOUNIER, Jérôme, LEPAGE, Patricia, MONDOT, Stanislas, GUILLOUX, Charles-Antoine, HERY-ARNAUD, Geneviève
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:The present invention relates to methods for predicting the risk of developing pulmonary colonization/infection by P. aeruginosa. The inventors analyzed the respiratory tract microbiota from 65 patients sputum samples and compared microbiota data. The inventors found that patients that will remain uninfected from P. aeruginosa exhibited 3-fold higher abundance of Porphyromonas compared to the other groups. In particular, the present invention relates to a method for predicting the risk of developing pulmonary colonization/infection by P. aeruginosa in a subject suffering from cystic fibrosis (CF) comprising measuring the abundance of Porphyromonas genus bacteria in a biological sample obtained from said subject. La présente invention concerne des procédés pour prédire le risque de développer une colonisation/infection pulmonaire par P. aeruginosa. Les inventeurs ont analysé le microbiote du tractus respiratoire à partir de 65 échantillons de crachats de patients et de données de microbiote comparées. Les inventeurs ont découvert que les patients qui restent non infectés par P. aeruginosa présentaient une abondance de Porphyromonas supérieure à 3 fois celle des autres groupes. En particulier, la présente invention concerne un procédé pour prédire le risque de développer une colonisation/infection pulmonaire par P. aeruginosa chez un sujet souffrant de fibrose kystique (CF) comprenant la mesure de l'abondance de bactéries du genre Porphyromonas dans un échantillon biologique obtenu à partir dudit sujet.