SYSTEMS AND METHODS FOR AUTOMATED, CUSTOMIZABLE SAMPLE PREPARATION TOOL, SOFTWARE SCRIPT, AND CALIBRATION ROUTINE FOR DETECTION OF METABOLITES AND LIPIDS

Described herein are automated and customizable sample preparation and analysis systems for detection and quantification of biomarkers (e.g., metabolites and/or lipids) in biological samples (e.g., blood, serum, or plasma) in a clinical setting. The automated systems are controlled by scripts that integrate communication between the components of the sample preparation system. Also described herein are mass spectrometry-based analytical methods featuring efficient system calibration and sample analysis that provide for accurate quantification of a set of markers in biological samples. The methods are capable of automatic high sample throughput in a clinical setting for detection and quantification using a mass spectrometry system and high performance liquid chromatography column. La présente invention se rapporte à des systèmes de préparation et d'analyse d'échantillons automatisés et personnalisables pour la détection et la quantification de biomarqueurs (par exemple, des métabolites et/ou des lipides) dans des échantillons biologiques (par exemple, sang, sérum ou plasma) dans un environnement clinique. Les systèmes automatisés sont commandés par des scripts qui intègrent la communication entre les composants du système de préparation d'échantillons. L'invention concerne également des procédés analytiques reposant sur la spectrométrie de masse à étalonnage de système et analyse d'échantillon efficaces qui permettent une quantification précise d'un ensemble de marqueurs dans des échantillons biologiques. Les procédés permettent un débit élevé d'échantillons automatique dans un environnement clinique pour la détection et la quantification à l'aide d'un système à spectrométrie de masse et une colonne à chromatographie liquide à haute performance.