DETECTION OF HIV-1 NUCLEIC ACIDS BY REVERSE-TRANSCRIPTION LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLICATION

Disclosed herein are methods of detecting HIV-1 nucleic acids in a sample (such as from a sample containing or suspected to contain HIV-1 nucleic acid). In some examples, the methods include loop-mediated isothermal amplification (LAMP) or reverse transcription-LAMP (RT- LAMP). In some examples, the methods include contacting a sample with one or more sets of LAMP primers specific for HIV-1 (such as LAMP primers specific for an HIV-1 integrase nucleic acid or LAMP primers specific for an HIV- 1 reverse transcriptase nucleic acid) under conditions sufficient to produce an amplification product and detecting the amplification product. Sets of LAMP primers for detection of HIV-1 integrase nucleic acids (such as SEQ ID NOs: 8-14 or 8-27) and HIV-1 reverse transcriptase nucleic acids (such as SEQ ID NOs: 1-7) are provided herein. L'invention concerne des procédés de détection d'acides nucléiques du VIH-1 dans un échantillon (par exemple un échantillon contenant ou soupçonné de contenir un acide nucléique du VIH-1). Selon certains exemples, les procédés comprennent une amplification isotherme médiée par des boucles (LAMP) ou une transcription inverse-LAMP (RT-LAMP). Selon certains exemples, les procédés consistent à mettre en contact un échantillon avec un ou plusieurs ensembles d'amorces pour LAMP spécifiques du VIH-1 (telles que des amorces pour LAMP spécifiques d'un acide nucléique d'intégrase du VIH-1 ou d'amorces pour LAMP spécifiques d'un acide nucléique de transcriptase inverse du VIH-1) dans des conditions suffisantes pour produire un produit d'amplification; et détecter le produit d'amplification. L'invention concerne également des ensembles d'amorces pour LAMP destinés à la détection d'acides nucléiques d'intégrase du VIH-1 (telles que SEQ ID NOs : 8 à 14 ou 8 à 27) et d'acides nucléiques de transcriptase inverse du VIH-1 (telles que SEQ ID NOs : 1 à 7).