METHOD AND USE FOR VERIFICATION OF MOUNTING ERRORS IN GENOMES

The present invention relates to a method for verification of mounting errors in genomes of organisms, which genomes have been sequenced or produced synthetically, which utilizes frequency relationships between nucleotide sequence fragments of a genome. The method is of use in the verification of errors in a mounted genome based on fragments produced using different types of sequencing technology and assists in the construction of synthetic genomes, for example. The present invention may be used to compress genetic material since the frequency relationships determined by the method allow reduction of the nucleotide sequence complexity in such a manner as to represent the content thereof in compressed form, thereby reducing the space required for storage thereof. La présente invention concerne un procédé de vérification d'erreurs de montage dans des génomes d'organismes séquencés ou produits de manière synthétique, faisant intervenir des rapports de fréquence entre fragments de séquences de nucléotides d'un génome. Le procédé trouve des applications dans la vérification d'erreurs dans un génome monté à partir de fragments provenant des différents types de technologies de séquençage et auxiliairement dans la construction de génomes synthétiques. Il peut être utilisé pour la compression de données de matériel génétique, les rapports de fréquence déterminés par le procédé permettant de réduire la complexité de séquences de nucléotides, de manière à représenter leur contenu de manière compressé, ce qui permet de réduire l'espace nécessaire pour leur stockage. A presente invenção trata de um método para a verificação de erros de montagem em genomas de organismos sequenciados ou produzidos de maneira sintética que utiliza relações de frequência entre fragmentos de sequências de nucleotídeos de um gerioma. O método possui aplicações na verificação de erros em jjm genoma montado a partir de fragmentos oriundos dos diferentes tipos de tecnologias de sequenciamerito e auxiliar na construção de genomas sintéticos. Pode ser empregado para a compressão de dados de material genético, pois as relações de frequência determinadas pelo método permitem reduzir a complexidade de sequências de nucleotídeos, de forma a representar o seu conteúdo de maneira comprimida, reduzindo assim o espaço necessário para o seu armazenamento.