DIAGNOSTIC METHYLATION MARKERS OF EPITHELIAL OR MESENCHYMAL PHENOTYPE AND RESPONSE TO EGFR KINASE INHIBITOR IN TUMOURS OR TUMOUR CELLS

The present invention provides methods for determining epithelial and mesenchymal phenotype of tumors and predicting whether tumor growth will be sensitive or resistant to treatment with an EGFR inhibitor. In particular, presence or absence of methylation of DNA at a CpG site in at least one gene selected from the group consisting of CLDN7, HOXC4, CP2L3, TBCD, ESPR1, GRHL2, ERBB2, and C20orf55 is provided as a marker of a mesenchymal phenotype in a tumour cell, for determining the sensitivity of tumor growth to inhibition by an EGFR kinase inhibitor, and/or for identifying a cancer patient who is likely to benefit from treatment with an EFGR inhibitor. Presence or absence of methylation of DNA at a CpG site in at least one gene selected from the group consisting of the PCDH8, PEX5L, GALR1, and ZEB2 is provided as a marker of epithelial phenotype of a tumor cell. La présente invention concerne des procédés de détermination du phénotype épithelial et mésenchymateux de tumeurs et de prédiction de savoir si la croissance tumorale sera sensible ou résistante au traitement par un inhibiteur d'EGFR. En particulier, l'invention concerne la présence ou l'absence d'une méthylation de l'ADN à un site CpG dans au moins un gène choisi dans le groupe consistant en CLDN7, HOXC4, CP2L3, TBCD, ESPR1, GRHL2, ERBB2 et C20orf55, en tant que marqueur d'un phénotype mésenchymateux dans une cellule tumorale, pour la détermination de la sensibilité de la croissance tumorale vis-à-vis de l'inhibition par un inhibiteur d'EGFR kinase, et/ou pour l'identification d'un patient atteint d'un cancer qui est susceptible de bénéficier du traitement par un inhibiteur d'EFGR. L'invention concerne la présence ou l'absence de méthylation d'ADN à un site CpG dans au moins un gène choisi dans le groupe consistant en PCDH8, PEX5L, GALR1 et ZEB2 en tant que marqueur d'un phénotype épithélial d'une cellule tumorale.