METHOD FOR RAPID IDENTIFICATION OF DRUG TARGETS AND DRUG MECHANISMS OF ACTION IN HUMAN CELLS

A method of identification of drug targets and drug resistance mechanisms in human cells of a drug comprising the steps of: generating at least one drug-resistant sample and at least one drug-sensitive sample; analyzing substantial portions of the genome and/or transcriptome of the least one drug-re...

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Hauptverfasser: ELEMENTO, OLIVIER, WACKER, SARAH A
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:A method of identification of drug targets and drug resistance mechanisms in human cells of a drug comprising the steps of: generating at least one drug-resistant sample and at least one drug-sensitive sample; analyzing substantial portions of the genome and/or transcriptome of the least one drug-resistant sample and drug-sensitive sample to obtain sequencing data; detecting substantially all alterations in the at least drug-resistant sample; deriving a resistance signature; and performing analysis of the drug resistance signature of at least one recurrently altered gene using bioinformatic tools and cellular biology methods to determine if alteration of the at least one gene of the drug resistance signature is sufficient to confer at least partial resistance to cells or tissues against the drug. L'invention concerne un procédé d'identification de cibles de médicament et de mécanismes de résistance aux médicaments dans des cellules humaines, concernant un médicament, comprenant les étapes consistant à : obtenir au moins un échantillon résistant au médicament et au moins un échantillon sensible au médicament ; analyser des portions substantielles du génome et/ou du transcriptome du ou des échantillons résistants au médicament et du ou des échantillons sensibles au médicament afin d'obtenir des données de séquençage ; détection de pratiquement toutes les altérations dans le ou les échantillons résistants au médicament ; obtention d'une signature de résistance ; et mise en oeuvre d'une analyse de la signature de résistance au médicament d'au moins un gène altéré de façon récurrente au moyen d'outils bio-informatiques et de méthodes de biologie cellulaire afin de déterminer si l'altération du ou des gènes de la signature de résistance au médicament est suffisante pour conférer une résistance au moins partielle aux cellules ou aux tissus contre le médicament.