GENOME ASSEMBLY

The invention generally relates to methods for assembling sequence contigs. In certain embodiments, methods of the invention involve converting sequence contigs into maps, generating a plurality of single molecule restriction maps, aligning single molecule restriction maps to ends of the maps of the sequence contigs, thereby producing extended sequence contigs, and aligning extended sequence contigs. La présente invention concerne de façon générale des méthodes d'assemblage de contigs de séquences. Dans certains modes de réalisation, les méthodes selon l'invention impliquent la conversion de contigs de séquences en cartes, générant une multitude de cartes de restriction à une seule molécule, l'alignement des cartes de restriction à une seule molécule aux extrémités des cartes des contigs de séquences pour obtenir des contigs de séquences étendus, et l'alignement des contigs de séquences étendus.