METHOD AND APPARATUS FOR COMPRESSING NUCLEOTIDE SEQUENCE DATA
The invention provides a data compression method, comprising: (a) obtaining a first reading sequence and a second reading sequence from an identical source by a receiving unit; (b) comparing the first reading sequence with the second reading sequence according to a comparison condition to generate a...
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Hauptverfasser: | , , |
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Format: | Patent |
Sprache: | eng ; fre |
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Zusammenfassung: | The invention provides a data compression method, comprising: (a) obtaining a first reading sequence and a second reading sequence from an identical source by a receiving unit; (b) comparing the first reading sequence with the second reading sequence according to a comparison condition to generate a sequence comparison result by the processor; (c) outputting a final template sequence according to the sequence comparison result by the processor; (d) comparing the final template sequence to each of the first and second reading sequences, to generate a respective difference between the final template sequence and each of the first and second reading sequences by the processor; and (e) compressing the first and second reading sequences according to the final template sequences and all generated differences between the final template sequence and the first and second reading sequences, to generate a compression file by the processor.
L'invention fournit un procédé de compression de données, comprenant les étapes consistant à : (a) obtenir une première séquence de lecture et une seconde séquence de lecture à partir d'une source identique avec une unité de réception; (b) comparer la première séquence de lecture avec la seconde séquence de lecture selon une condition de comparaison de façon à générer un résultat de comparaison de séquence avec le processeur; (c) délivrer en sortie une séquence de matrice finale selon le résultat de la comparaison de séquence avec le processeur; (d) comparer la séquence de matrice finale avec chacune des première et seconde séquences de lecture, de façon à générer une différence respective entre la séquence de matrice finale et chacune des première et seconde séquences de lecture avec le processeur; et (e) compresser les première et seconde séquences de lecture selon les séquences de matrices finales et toutes les différences générées entre la séquence de matrice finale et les première et seconde séquences de lecture, de façon à générer un fichier de compression avec le processeur. |
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