A METHOD FOR VISUALIZING A DNA SEQUENCE

The present invention relates to a method for visualizing a DNA sequence (10) (or RNA or amino acid sequence), the method involves providing a DNA sequence (10), creating a plurality of frequency domain spectra (20) based on the DNA sequence, providing a database (DB) with corresponding DNA features (100c) and genomic annotation information (ANN), associating a portion of the DNA sequence (10 ) with a DNA feature (100c) from the database, and displaying the plurality of spectra (20) in combination with the genomic annotation information (ANN) associated to each spectrum. The invention is advantageous for obtaining an improved visualization method for spectral DNA analysis. Moreover, genomic features such as known repeats and CpG islands, transcribed regions such as genes and microRNAs and epigenomic features such as DNA methylation, histone modifications, and any other feature that can be assigned genomic coordinates can be annotated and displayed according to the invention. L'invention concerne un procédé pour visualiser une séquence d'ADN (10) (ou une séquence d'ARN ou d'acides aminés). Ledit procédé consiste : à faire appel à une séquence d'ADN (10); à créer plusieurs spectres de domaine de fréquence (20) en fonction de la séquence d'ADN; à utiliser une base de données (DB) dotée de caractéristiques d'ADN (100c) et d'informations d'annotation génomiques (ANN); à associer une partie de la séquence d'ADN (10 ) à une caractéristique d'ADN (100c) provenant de la base de données; et à afficher la pluralité de spectres (20) combinés aux informations d'annotation génomiques (ANN) associées à chaque spectre. L'intérêt de l'invention est qu'elle permet d'obtenir un procédé de visualisation amélioré pour effectuer une analyse spectrale d'ADN. De plus, les caractéristiques génomiques, telles que des répétitions connues et des îlots CpG, des régions transcrites, telles que des gènes et des micro ARN et des caractéristiques épigénomiques telles que des méthylations d'ADN, des modifications d'histone et autre caractéristique quelconque auxquelles on peut attribuer des coordonnées génomiques, peuvent être annotées et affichées en fonction de l'invention.