METHOD FOR THE SIMULATION OF MOLECULAR BINDING WITH A FLEXIBLE RECEPTOR USING A NOVEL SCORING FUNCTION

The invention relates to the field of bioinformatics and, more specifically, to the use of said branch of science for the development of novel molecules that are suitable for therapeutic use in human health. The invention relates to a novel system and method of simulating molecular binding between a protein and any other chemical molecule. The invention is advantageous in that it enables a broad exploration of the flexibility of the receptor in the zone of the ligand-binding site, as well as of the flexibility of the actual ligand. The method can be performed quickly and efficiently such that it is suitable for use in the virtual screening of large databases of 3D molecular structures, in order to find candidates for binding to a particular protein. The inventive method uses a scoring function that is based on statistical interaction potentials. La presente invención se enmarca en el campo de la bioinformática y mas específicamente en el uso de esta rama de la ciencia para el desarrollo de nuevas moléculas con uso terapéutico en la salud humana. En la presente invención se describe un nuevo sistema y procedimiento para realizar simulaciones de acoplamiento molecular entre una proteína y otra molécula de cualquier naturaleza química, con la ventaja que permite realizar una exploración amplia de la flexibilidad del receptor en la zona del sitio de unión del ligando, así como de la flexibilidad del propio ligando. La rapidez y eficiencia del método hace posible su empleo en el tamizaje virtual de grandes bases de datos de estructuras 3D de moléculas, en busca de candidatos a unirse a una proteína de interés. El procedimiento de la presente invención utiliza una función de puntuación basada en potenciales estadísticos de interacción. L'invention a trait au secteur de la bioinformatique et, plus particulièrement, à l'utilisation de cette branche de la science pour la mise au point de nouvelles molécules à usage thérapeutique pour la santé humaine. L'invention concerne un nouveau système et un procédé permettant de réaliser des simulations d'accouplement moléculaire entre une protéine et une autre molécule à nature chimique quelconque, s'ensuit avantageusement la vaste exploration de la flexibilité du récepteur dans la zone du site d'union du ligand d'une part et de la flexibilité du ligand à proprement parlé d'autre part. La rapidité et l'efficacité du procédé se prêtent au tamisage virtuel de grandes bases de données de structures 3D de molécules à la recherch