MATERIALS AND METHODS FOR THE PHOTODIRECTED SYNTHESIS OF OLIGONUCLEOTIDE ARRAYS

Materials and methods for photodirected synthesis of oligonucleotide arrays on a solid substrate by photodirected synthesis are disclosed which employ a film formed from (i) a photoacid generator that on photolysis generates acid that is capable of directly removing the protecting group of the linker molecules or oligonucleotides and (ii) a polymer substantially lacking electronegative heteroatoms that are capable of hydrogen bonding with photogenerated acid. Methods of synthesizing an oligomer arrays are also described that use a film that restricts diffusion of reactants and products on the substrate during synthesis of the array and which includes a precursor of a deprotecting reagent. The method involves removing one or more of the non-required products of the deprotection reaction from the reactive array elements at which they are produced during the reaction, in order to displace the deprotection reaction towards completion. L'invention concerne des matières et des procédés destinés à la synthèse photodirigée de réseaux d'oligonucléotides sur un substrat solide par synthèse photodirigée à l'aide d'un film formé à partir de (i) un générateur photoacide qui en photolyse génère un acide permettant d'éliminer directement le groupe protecteur des molécules de liants ou des oligonucléotides et (ii) un polymère sensiblement dépourvu d'hétéroatome électronégatif permettant la liaison hydrogène avec l'acide photogénéré. L'invention concerne également des procédé de synthèse d'un réseau d'oligomère qui utilise une film réduisant la diffusion de réactifs et de produits sur le substrat durant la synthèse du réseau et qui comprend un précurseur de réactif des protecteurs. Le procédé consiste à éliminer un ou plusieurs produits non nécessaires de la réaction de déprotection à partir des éléments de réseau réactifs au niveau desquels ils sont produits durant la réaction, afin de déplacer la réaction de déprotection vers l'exécution.