METHOD AND SYSTEM FOR AUTOMATICED DIGITAL IMAGE BASED FLOURESCENT IN SITU HYBRIDIZATION (FISH) ANALYSIS

A method and system for automated digital fluorescent in situ hybridization (FISH) image analysis. Luminance parameters from a digital image of a biological tissue sample to which a fluorescent compound (e.g., LSI-HER-2/neu and CEP-17 dyes) have been applied are analyzed to determine plural regions...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: GHOLAP, GAURI, A, PARDESHI, DEEPAK, K, ABHYANKAR, JAYANT, JADHAV, PRITHVIRAJ, RAO, C., K., V, GHOLAP, ABHIJEET, S, VIPRA, MADHURA
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:A method and system for automated digital fluorescent in situ hybridization (FISH) image analysis. Luminance parameters from a digital image of a biological tissue sample to which a fluorescent compound (e.g., LSI-HER-2/neu and CEP-17 dyes) have been applied are analyzed to determine plural regions of interest. Fluorescent color signals in the plural regions of interest including plural cell nuclei are identified, classified and grouped into plural groups. Each of the plural groups is validated based on pre-defined conditions. A medical diagnosis or prognosis or medical, life science or biotechnology experiment conclusion determined using a count of plural ratios of validated fluorescent color signals within each of the cell nuclei within the plural groups. L'invention concerne un procédé et un système pour l'analyse automatique d'hybridation in situ par fluorescence à base d'image numérique. On analyse des paramètres de luminance à partir d'une image numérique d'échantillon de tissu biologique auquel a été appliqué un composé fluorescent (par exemple, colorants LSI-HER-2/neu et CEP-17) pour déterminer plusieurs zones d'intérêt. On identifie ainsi des signaux de couleurs fluorescentes dans ces zones comprenant plusieurs noxauy cellulaires d'intérêt, que l'on classe et réunit en plusieurs groupes. Chaque groupe est validé sur la base de conditions préétablies. Cela permet de fournir un diagnostic médical ou un pronostic médical ou bien encore de tirer une conclusion d'expérience médicale, biologique ou biotechnologique en utilisant une série de plusieurs rapports de signaux de couleurs fluorescentes validés dans chacun des noyaux cellulaires à l'intérieur des différents groupes.