METHOD OF SCREENING CARCINOGENECITY OF CHEMICAL

It is intended to provide a method of screening carcinogenicity of a chemical which can be conveniently and highly reproducibly carried out at a lower cost within a short period of time; and a microarray and a gene set appropriately usable in screening carcinogenicity of a chemical as described abov...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: SHIRAI, TOMOYUKI, SATOH, TAKATOMO, ASAMOTO, MAKOTO
Format: Patent
Sprache:eng ; fre ; jpn
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Beschreibung
Zusammenfassung:It is intended to provide a method of screening carcinogenicity of a chemical which can be conveniently and highly reproducibly carried out at a lower cost within a short period of time; and a microarray and a gene set appropriately usable in screening carcinogenicity of a chemical as described above. The expression amount of a liver cancer-associated gene, from among genes involved in mammalian genome, is detected. More specifically speaking, a chemical having known carcinogenicity and another chemical having unknown carcinogenicity are administered to mammals or their liver cells are treated by these chemicals. Then mRNA is extracted from vital liver cells of mammals of the chemical-treated group and mammals of the untreated group and the expression amount of the target gene is analyzed. Based on the results of the analysis, clustering analysis is further carried out to thereby screen the carcinogenicity of the chemical having unknown carcinogenicity as described above. A gene set comprising a probe hybridizable with the base sequence of mRNA transcribed from the target gene as described above or a sequence complementary to the mRNA as described above. A microarray having this probe loaded thereon. L'invention porte sur un procédé de dépistage de la carcinogénicité d'un produit chimique qui peut être mis en oeuvre correctement et être reproduit un bon nombre de fois à un coût peu élevé dans un laps de temps bref; et un micro-réseau ainsi qu'un ensemble de gènes que l'on utilise convenablement dans le dépistage de la carcinogénicité d'un produit chimique tel que décrit ci-dessus. La quantité d'expression d'un gène associé au cancer du foie, parmi des gènes impliqués dans un génome mammifère, est détectée. Plus spécifiquement, un produit chimique ayant une carcinogénicité connue et un autre produit chimique ayant une carcinogénicité non connue sont administrés à des mammifères ou à leurs cellules hépatiques et sont traités par ces produits chimiques. L'ARNm est ensuite extrait des cellules hépatiques virales des mammifères du groupe traité par un produit chimique et des mammifères du groupe non traité et la quantité d'expression du gène cible est analysée. D'après les résultats de l'analyse, on mène ensuite une analyse par segmentation afin de dépister la carcinogénicité du produit chimique ayant une carcinogénicité inconnue. L'ensemble de gènes comprend une sonde qui peut être hybridée avec la séquence de base de l'ARNm transcrit depuis le gène cible ou a