METHODS AND APPARATUS FOR GENETIC EVALUATION

Rapid and definitive bioagent detection and identification can be carried out without nucleic acid sequencing. Analysis of a variety of bioagents and samples, such as air, fluid, and body samples, can be carried out to provide information useful for industrial, medical, and environmental purposes. N...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	RUDNICK, KARL, H, BAR-ON, JONATHAN, R, CROOKE, STANLEY, T, SOFIANOS, DINO, J, SAMPATH, RANGARAJAN, BASHAM, CECIL, L., JR, ECKER, DAVID, J, HOFSTADLER, STEVEN, A, ROBBINS, DAVID, W, PENHUNE, JOHN, P, LEWIS, CLIFFORD, T, MURRAY, DENNIS, P, GRIFFEY, RICHARD, H, KNIZE, DUANE, J, MCNEIL, JOHN, LARSON, BRONS, M, STOUGHTON, ROLAND, B
Format:	Patent
Sprache:	eng ; fre
Schlagworte:	BEER BIOCHEMISTRY CALCULATING CHEMISTRY COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR COMPUTING CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES COUNTING DIAGNOSIS ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING ENZYMOLOGY HUMAN NECESSITIES HYGIENE IDENTIFICATION INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES MEASURING MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE METALLURGY MICROBIOLOGY MUTATION OR GENETIC ENGINEERING PHYSICS PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS SPIRITS SURGERY TESTING VINEGAR WINE
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Beschreibung
Zusammenfassung:	Rapid and definitive bioagent detection and identification can be carried out without nucleic acid sequencing. Analysis of a variety of bioagents and samples, such as air, fluid, and body samples, can be carried out to provide information useful for industrial, medical, and environmental purposes. Nucleic acid samples of unknown or suspected bioagents may be collected, optimal primer pairs may be selected, and the nucleic acid may be amplified. Expected mass spectra signal models may be generated and selected, the actual mass spectra of the amplicons may be obtained. The expected mass spectra most closely correlating with the actual mass spectra may be determined using a joint maximum likelihood analysis, and base counts for the actual mass spectra and the expected mass spectra may be obtained. The most likely candidate bioagents may then be determined. Selon l'invention, une détection et une identification rapide et définitive d'agents biologiques peuvent être exécutées sans qu'il soit nécessaire de procéder à un séquençage d'acide nucléique. L'analyse de toute une variété d'agents biologiques et d'échantillons tels que des échantillons d'air, de fluide et corporels, peut être exécutée pour l'obtention d'informations utiles à des fins industrielles, médicales et environnementales. Des échantillons d'acides nucléiques d'agents biologiques inconnus ou suspects peuvent être collectés, des paires d'amorces optimales peuvent être sélectionnées, et l'acide nucléique peut être amplifié. Des modèles de signaux de spectres de masse attendus peuvent être générés et sélectionnés, et les spectres de masse réels des amplicons peuvent être obtenus. Les spectres de masse attendus présentant le plus fort degré de corrélation avec les spectres de masse réels peuvent être déterminés par analyse de probabilité maximale conjointe, et on peut obtenir les comptes de bases pour les spectres de masse réels et les spectres de masse attendus. Les agents biologiques candidats les plus probables peuvent ensuite être déterminés.