VISUALIZING EXPRESSION DATA ON CHROMOSOMAL GRAPHIC SCHEMES

Systems and methods for displaying gene- and/or protein- related data with respect to chromosome maps at locations identifying relevant positioning of the genes with which the gene- and/or protein related data are associated. Multiple experiments may be plotted onto the display adjacent one or more...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: LEONARD, LESLIE, A, BEN-DOR, AMIR, SAMPAS, NICK, YAKHINI, ZOHAR, H, KINCAID, ROBERT
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Beschreibung
Zusammenfassung:Systems and methods for displaying gene- and/or protein- related data with respect to chromosome maps at locations identifying relevant positioning of the genes with which the gene- and/or protein related data are associated. Multiple experiments may be plotted onto the display adjacent one or more chromosome maps. Automatic extraction of genomic location, based on accession numbers or other unique identifiers and cross connection with expression data is provided. Statistical assessments of correlations between expression and genome localization may be performed. Zooming capabilities, thumbnail/fullview toggling, browsability and linked data may be included as features of the visualization systems described. L'invention concerne des systèmes et des procédés pour l'affichage de données relatives à des gènes et/ou à des protéines, par rapport à des cartes chromosomiques en des points identifiant la position correspondante des gènes auxquels les données relatives aux gènes et/ou protéines sont associées. De multiples expériences peuvent être représentées sur l'affichage, à proximité d'une ou plusieurs cartes chromosomiques. L'extraction automatique de l'emplacement génomique, selon les numéros d'ordre ou d'autres identificateurs particuliers, et la connexion transversale avec les données d'expression est assurée. Les évaluations statistiques des corrélations entre l'expression et la localisation génomique peuvent être assurées. Des fonctions de zoomage, de basculement sur vignette/vue complète, de recherche libre et des données enchaînées peuvent être incluses en tant que caractéristiques des systèmes de visualisation décrits.