CRYSTAL STRUCTURE OF MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE-ACTIVATED PROTEIN KINASE 2 AND BINDING POCKETS THEREOF

The invention relates to crystalline molecules or molecular complexes that comprise binding pockets of mitogen activated protein kinase activated protein kinase 2 (MAPKAPK2) or its homologues. The invention also relates to crystals comprising MAPKAPK2. The present invention also relates to a computer comprising a data storage medium encoded with the structural coordinates of MAPKAPK2 binding pockets and methods of using a computer to evaluate the ability of a compound to bind to the molecule or molecular complex. This invention also relates to methods of using the structure coordinates to solve the structure of homologous proteins or protein complexes. In addition, this invention relates to methods of using the structure coordinates to screen for, design and optimize compounds, including agonists and antagonists, which bind to MAPKAPK2 or homologues thereof. Cette invention concerne des molécules cristallines ou des complexes moléculaires renfermant des poches de fixation de protéine kinase 2 activée par la protéine kinase activée par des agents mitogènes (MAPKAPK2) ou ses homologues. Elle a également trait à des cristaux contenant la MAPKAPK2. Elle porte, en outre, sur un ordinateur pourvu d'un support de stockage de données codées au moyen des coordonnées de structure des poches de fixation de la MAPKAPK2 ainsi que sur des méthodes d'utilisation de cet ordinateur pour évaluer l'aptitude d'un composé à se fixer à la molécule ou aux complexes moléculaires susmentionnés. L'invention concerne, de surcroît, des méthodes d'utilisation des coordonnées de structure pour résoudre la question de la structure de protéines homologues ou de complexes protéiques. Elle porte, enfin, sur des méthodes d'utilisation de ces coordonnées permettant de cribler, de mettre au point et d'optimiser des composés, notamment des agonistes et des antagonistes, se fixant à la MAPKAPK2 ou à ses homologues.