METHODS FOR LARGE SCALE PROTEIN MATCHING

The present invention provides methods for matching a sample of an unknown query peptide to a database of known peptides. The methods described herein allow for the rapid, sensitive, and selective identification of an unknown query peptide, which enables the development of high throughput protein identification. The methods described herein also allow for mass spectrometry data for a query peptide to be categorized and weighted according to its quality. Furthermore, the methods described herein provide robust identification of modified query proteins by either anticipating modifications or adjusting for modified peptide masses. Cette invention concerne des procédés d'appariement d'un échantillon d'un peptide d'interrogation inconnu avec une base de données de peptides connus. Ces procédés permettent une identification rapide, sensible et sélective d'un peptide d'interrogation inconnu, laquelle identification permet le développement de l'identification de protéines à haute capacité. Ces procédés permettent également à des données à spectrométrie de masse relatives à un peptide d'interrogation d'être classées par catégorie et pesées en fonction de leur qualité. En outre, ces procédés assurent une identification robuste de protéines d'interrogation modifiées soit par l'anticipation des modifications, soit par l'ajustement des masses de peptides modifiés.